VAULT RNA 1-2; VTRNA1-2
- HVG2
- Vault RNA 成分 2; VAULTRC2
HGNC 批准的基因符号:VTRNA1-2
细胞遗传学位置:5q31.3 基因组坐标(GRCh38):5:140,718,925-140,719,012(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
穹窿体是大型细胞质核糖核蛋白,主要由 MVP(605088) 和非翻译穹窿体 RNA 成分组成。 通过对人类基因组 DNA 文库进行 PCR,Kickhoefer 等人(1998)克隆了3个vault RNA基因,HVG1(VTRNA1-1; 612695)、HVG2(VTRNA1-2)和HVG3(VTRNA1-3; 612697)。 HVG2 和 HVG3 均含有 86 个碱基,并具有内部 RNA 聚合酶 III(参见 606007)型启动子元件和典型的聚合酶 III 终止信号。 与 HVG1 相比,它们都有内部 10 个碱基缺失。
基克霍弗等人(1999) 发现在所有检查的人类细胞系中仅表达 HVG1。 当表达时,HVG2 和 HVG3 通常与上清液级分相关,而不是与含有穹窿的微粒体沉淀相关。
南迪等人(2009)描述了VTRNA1-2的结构。 88 个核苷酸的 RNA 形成具有不对称内部凸起的延伸茎环结构。 它包含特征性内部聚合酶 III A 框和 B 框启动子元件以及下游 B2 框基序。 对分级的 HeLa 细胞进行尺寸排阻色谱分析,然后进行 Northern 和 Western 印迹分析,检测到用 MVP 洗脱的约 5% 的 VTRNA1-1 和 VTRNA1-2 含量,而 95% 保留在上清液中。
▼ 基因功能
基克霍弗等人(1998) 发现 HVG1,而不是 HVG2 或 HVG3,与人类细胞系中的穹窿相关。
南迪等人(2009) 发现感染 Epstein-Barr 病毒(EBV) 的脐带血淋巴细胞中 VTRNA1-1、VTRNA1-2、VTRNA1-3 和 CBL3(VTRNA2-1; 614938) 的表达上调。 VTRNA1-1 的上调最高(约 1,100 倍),CBL3 的上调最低(约 3 倍)。 VTRNA1-1、VTRNA1-2 和 CBL3 的表达也被 EBV 相关的卡波西肉瘤病毒上调,但其他病毒家族的成员则没有上调。
▼ 基因结构
基克霍弗等人(2003) 确定 VTRNA1-2 基因的上游区域包含 TATA 样元件、共有近端序列和 cAMP 响应元件。
▼ 测绘
基克霍弗等人(2003) 指出 VTRNA1-1、VTRNA1-2 和 VTRNA1-3 基因对应到 5 号染色体的 16 kb 区域。
南迪等人(2009) 指出 VTRNA1-2 基因位于 PCDHA 基因簇(604966) 附近,Wu 和 Maniatis(1999) 将其对应到染色体 5q31。