核糖体 RNA 处理 8; RRP8

• 核糖体 RNA 加工蛋白 8，甲基转移酶，酿酒酵母，同源物
• 核梅素；NML
• KIAA0409

HGNC 批准的基因符号：RRP8

细胞遗传学位置：11p15.4 基因组坐标（GRCh38）：11:6,514,829-6,603,677（来自 NCBI）

▼ 说明

核糖体生物合成是最消耗能量的细胞过程，并适应细胞内能量状态的变化。 RRP8 是能量依赖性核仁沉默复合物（ENOSC） 的关键组成部分，它在营养剥夺期间下调核糖体 RNA（rRNA） 转录，从而减少能量消耗并提高细胞存活率（Murayama 等，2008；Yang 等（2013））。

▼ 克隆与表达

Ishikawa 等人通过对从尺寸分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序（1997） 克隆了 RRP8，他们将其命名为 KIAA0409。 转录本的 3 引物末端含有重复元件，推导的蛋白质含有 464 个氨基酸。 RT-PCR 在所有检查的 14 个人体组织中检测到可变的 RRP8 表达。 通过 SDS-PAGE 检测，体外翻译的 RRP8 的表观分子量为 57 kD。

村山等人（2008） 报道称全长 RRP8，他们称之为核甲基蛋白（NML），包含 456 个氨基酸，并具有一个 C 末端结构域，其具有在 S-腺苷甲硫氨酸（SAM） 依赖性甲基转移酶中发现的共有基序。 免疫荧光显微镜将 NML 定位于 HeLa 细胞核仁。

▼ 基因功能

Murayama 等人使用多种与人类细胞系的蛋白质相互作用测定（2008） 发现 NML 与 ENOSC 成分 SIRT1（604479） 和 SUV39H1（300254） 以及沉默核糖体 DNA（rDNA） 中的 lys4-二甲基化组蛋白 H3（参见 602810）相互作用。 人类细胞系中 NML 的敲低减少了 SIRT1 和 SUV39H1 与 rDNA 的关联，增强了前 rRNA 和蛋白质合成，减少了组蛋白 H3 中 lys9 的乙酰化和升高的甲基化，并增加了营养剥夺后的细胞死亡。 SIRT1 或 SUV39H1 的敲低对 rRNA 合成和细胞存活具有类似的影响。 无法结合 SAM 的 NML 突变体与 SIRT1、SUV39H1 和染色质相互作用，但不能保护细胞免受饥饿诱导的细胞凋亡。

杨等人（2013） 发现人类 NML 以序列无关的方式结合天然和合成的 RNA。 他们将 NML 的 RNA 结合区域对应到富含赖氨酸和精氨酸的 N 末端结构域，该结构域与中央 SIRT1 结合结构域部分重叠。 RNA 结合结构域还包含核仁定位所需的高度保守的富含赖氨酸和精氨酸的子结构域。 NML 和 SIRT1 之间的结合被 rRNA 竞争性抑制，导致 ENOSC 从 rDNA 解离并缓解 rRNA 转录抑制。 杨等人（2013） 假设在营养丰富的条件下，ENOSC 在核仁中 rDNA 上的组装受到新生 rRNA 的抑制。 然而，在营养缺乏或其他减少 RNA 聚合酶 I（参见 602000）转录输出的压力下，低细胞 rRNA 含量允许 ENOSC 组装，进一步抑制 rRNA 转录。

▼ 生化特征

村山等人（2008） 以 2.0 埃的分辨率确定了与 SAM 复合的 NML 的 C 端甲基转移酶样结构域（氨基酸 242-456）的晶体结构。 C端结构域折叠成一个大结构域和一个小结构域。 大结构域由 SAM-甲基转移酶折叠特征的 α 螺旋和 β 折叠组成，小结构域具有 3 个通过疏水相互作用紧贴 SAM-甲基转移酶折叠的 α 螺旋。

▼ 测绘

通过辐射混合分析，Ishikawa 等人（1997） 将 RRP8 基因定位到 11 号染色体。

Hartz（2014） 根据 RRP8 序列（GenBank AB007869） 与基因组序列（GRCh37） 的比对，将 RRP8 基因对应到染色体 11p15.4。