跨膜蛋白 129; TMEM129
HGNC 批准的基因符号:TMEM129
细胞遗传学位置:4p16.3 基因组坐标(GRCh38):4:1,715,951-1,721,372(来自 NCBI)
▼ 说明
内质网(ER) 相关降解(ERAD) 以错误折叠或未组装的蛋白质为目标,在胞质溶胶中进行泛素化和蛋白酶体介导的降解。 TMEM129 是一种泛素 E3 连接酶,在 ERAD 复合物中发挥作用(van den Boomen 等,2014)。
▼ 克隆与表达
US11 是一种人类巨细胞病毒蛋白,通过针对新翻译的细胞表面主要组织相容性复合物(MHC) I 类(参见 HLA-A,142800)分子进行 ERAD 依赖性降解,促进免疫逃避。 van den Boomen 等人使用 KBM7 人骨髓性白血病细胞进行正向遗传筛选,寻找促进 US11 依赖性 MHC I 类降解的因素(2014) 鉴定了 TMEM129。 推导的 362 个氨基酸蛋白具有 3 个 N 端跨膜结构域和一个胞质 C 端仅半胱氨酸的 RING 结构域,具有典型的 E2 泛素缀合酶结合位点。 表位标记的 TMEM129 与 HeLa 细胞中的 ER 驻留标记共定位。 蛋白质印迹分析检测到 TMEM129 的表观分子质量为 36 kD。 数据库分析显示 TMEM129 在后生动物祖先 Capsaspora 中保守,但在酵母中则不然。
▼ 基因功能
范登布门等人(2014) 发现巨细胞病毒 US11 与内质网新翻译的 MHC I 类结合,并通过 TMEM129 靶向 MHC I 类进行泛素化。 TMEM129 预计可与 E2 泛素缀合酶 UBE2J2(619756) 一起发挥作用。 通过基因打靶(GT) 敲低 TMEM129 可恢复细胞表面 MHC I 类表达,并在表达 US11 的人 KBM7 和 HeLa 细胞以及巨细胞病毒感染的成纤维细胞中部分恢复 HLA-A2。 TMEM129 的敲低也增加了 US11 的表达。 用野生型 TMEM129 转染 TMEM129(GT) 细胞可恢复 US11 介导的泛素化和细胞表面 MHC I 类的下调。免疫沉淀分析显示 TMEM129 直接与 derlin-1(DERL1; 608813) 相互作用,并且 derlin-1 介导 TMEM129 与 US11 的相互作用。 在 E1 泛素激活酶(314370) 和 E2 缀合酶存在的情况下,含有 TMEM129 RING 结构域的表达构建体在体外显示出自身泛素化活性。 TMEM129 RING 结构域中锌配位半胱氨酸的突变消除了自身泛素化活性,并且该突变体未能恢复 US11 介导的 MCH I 类下调。 范登布门等人(2014) 得出结论,TMEM129 是一种 E3 连接酶,在 ERAD 依赖性蛋白质降解中发挥核心作用。
▼ 基因结构
范登布门等人(2014)确定TMEM129基因包含4个外显子。
▼ 测绘
Hartz(2014) 根据 TMEM129 序列(GenBank BC009331) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 TMEM129 基因对应到染色体 4p16.3。