PWP2 小亚基加工组件; PWP2
- 周期性色氨酸蛋白 2,酵母,同源物
- PWP2H
HGNC 批准的基因符号:PWP2
细胞遗传学位置:21q22.3 基因组坐标(GRCh38):21:44,107,398-44,131,180(来自 NCBI)
▼ 说明
PWP2 是一种核仁蛋白,主要定位于致密纤维成分(与早期核糖体 RNA(rRNA) 加工事件相关)和颗粒成分(与晚期 rRNA 加工事件和核糖体颗粒组装相关)(Wada 等,2014)。
▼ 克隆与表达
作为识别可能与唐氏综合症有关的基因的研究的一部分,Lalioti 等人(1996) 使用来自已对应到 21q22.3 的粘粒的外显子捕获。 分离出一个外显子,该外显子编码与酵母 PWP2 基因相似的预测蛋白,PWP2 基因是色氨酸-天冬氨酸(WD) 重复序列超家族的成员。 PWP2 对于活力至关重要,并且可能在细胞周期的早期 G1 期发挥作用。 从胎儿脑和胎儿肾 cDNA 文库中获得的人 PWP2 完整编码区编码 919 个氨基酸的预测蛋白,与酵母蛋白具有超过 40% 的同一性。 它还与三聚体 G 蛋白家族的 β 亚基(例如 139380)具有相似性。 该蛋白质包含 5 个完整的 WD 重复序列以及第二个和第三个 WD 基序之间的酸性结构域。 Northern 印迹分析显示,所有检查的胎儿和成人组织中均存在 3.4 kb PWP2 mRNA。
为了确定对应到 21q22.3 的疾病候选基因,Lafreniere 等人(1996) 组装了一个 770 kb 的粘粒和一个包含 8 个紧密连锁标记的 BAC 重叠群。 然后,他们使用 8 种稀有切割酶对这些粘粒和 BAC 进行限制性图谱,目的是识别富含 CpG 的岛。 使用来自这样一个岛的序列进行同源性搜索,鉴定出与酵母的 PWP2 同源的表达序列标签(EST)。 Northern 印迹分析显示,3.3 kb 的转录物在所有测试组织中均高度表达。 3,157 bp 的 cDNA 包含一个可能编码 919 个氨基酸残基的开放解读码组。 预测的蛋白质在氨基酸水平上与酵母 PWP2 蛋白质有 42% 的同一性和 57% 的相似性。
通过对人类前列腺和睾丸 cDNA 文库进行 PCR,Wada 等人(2014) 克隆 PWP2。 荧光标记的 PWP2 定位于转染的 HeLa 细胞的整个核仁,主要定位于致密纤维成分和颗粒成分。 光漂白后的荧光恢复表明PWP2与核仁稳定结合,并且PWP2与核仁的结合不受转录抑制的影响。
▼ 基因结构
拉法尼尔等人(1996) 确定 PWP 基因分为 21 个外显子,大小范围为 53 至 516 bp,跨度估计为 25 kb。 该基因以 21cen-to-21qter 方向转录,其 5-prime 末端位于距 PFKL 基因 5-prime 末端近端约 195 kb 处。
▼ 测绘
基于粘粒重叠群分析,Lalioti 等人(1996) 将 PWP2 基因定位到染色体 21q22.3,距 PFKL(171860) 近端约 200 kb。
孤立地,山川等人(1996) 从 21q22.3 区域分离出 PWP2H 基因。