鼻咽癌,易感性,2; NPCA2
细胞遗传学定位:6p21.3 基因组坐标(GRCh38):6:33,500,000-36,600,000
▼ 说明
鼻咽癌是一种多因素恶性肿瘤,与遗传和环境因素有关。 癌症起源于鼻咽上皮(Tse 等人,2009 年总结)。
有关鼻咽癌易感性的遗传异质性的一般表型描述和讨论,请参见 NPCA1(607107)。
▼ 测绘
在一个斯堪的纳维亚血统的美国家庭的 3 代人中,Coffin 等人(1989,1991)发现5例鼻咽癌和6例其他恶性肿瘤。 此外,该家族还有自身免疫性疾病史,包括恶性贫血、甲状腺疾病和牛皮癣。 作者观察到 HLA 单倍型 A1-B37-DR6(参见,例如 HLA-A;142800)的频率增加,该单倍型对应到染色体 6p21,在受影响的家庭成员中。
陈等人(1983) 发现单倍型 A2、Bw46 和抗原 B17 的相对风险略高于 2 倍。
卢等人(1990) 报道了一项基于受影响同胞对的连锁研究,表明与 HLA 区域紧密连锁的基因会大大增加患鼻咽癌的风险。 最大似然估计将相对风险约为 21。
奥伊等人(1997) 发现 HLA-Bw46 位点与 NPCA 风险增加存在关联。
在对台湾人群中 277 名 NPCA 患者和 285 名对照者进行的全基因组关联研究中,Tse 等人(2009) 鉴定了 12 个对应到染色体 6p21.3 的重要 SNP。 在 2 个孤立组中复制了关联性,其中包括 339 名 NPC 患者和 696 名对照者,以及 296 名 NPC 患者和 944 名对照者。 所有病例和对照均为汉族。 两个最显着的 SNP 位于 HLA-A 基因 rs2517713 和 rs2975042 中,其组合 p 值分别为 = 3.9 x 10(-20) 和 1.6 x 10(-19)。 谢等人(2009) 还检测到 NPCA 与该染色体区域中的 GABBR1(603540) 基因中的 SNP 之间存在显着关联:rs29232,(p = 8.97 x 10(-17)),在调整年龄、性别和 HLA 相关 SNP 后,该关联仍然显着(p 小于 5 x 10(-4))。 与邻近的上皮细胞相比,肿瘤细胞中的 GABBR1 表达水平更高。 HLA-F 基因(143110) 中的另外两个 SNP 也显示与 NPCA 相关(rs3129055, p = 7.36 x 10(-11); 9258122, 3.33 x 10(-10))。