TAF13 RNA 聚合酶 II，TATA 框结合蛋白相关因子，18-KD; TAF13
- TATA框结合蛋白相关因子2K；TAF2K
- TBP 相关因子，RNA 聚合酶 II，18-KD；TAFII18
HGNC 批准的基因符号：TAF13
细胞遗传学定位：1p13.3 基因组坐标（GRCh38）：1:109,064,139-109,076,002（来自 NCBI）
▼ 描述
TAF13 基因是至少 2 个蛋白质复合物的组成部分，即 TFIID 复合物和小核 RNA 基因特异性 TAF 复合物（snTAFc），它们在真核细胞基因转录的调节中发挥着关键作用（Tawamie 等人的总结，2017）。
RNA 聚合酶 II（参见 180660）对转录的控制涉及基础转录机制，这是一组蛋白质，包括 TFIIB（TF2B；189963）、TFIIE（参见 189962）、TFIIF（参见 189968）、TBP（600075）、TFIIA 和 TAFII250（TAF2A；313650）。它们与 RNA 聚合酶 II 一起组装成复合物，并受到反式激活蛋白的调节，反式激活蛋白与位于转录起始位点附近的顺式调控元件结合。一些调节剂直接与基础复合物相互作用，而另一些调节剂可能充当桥接蛋白，将反式激活因子与基础转录因子连接起来。其中一些相关因子的附着力较弱，而另一些则与 TFIID 复合物中的 TBP 紧密相关。后者包括 TAF 蛋白。TFIID 复合物的 TAF 成分已从果蝇细胞和 HeLa 细胞中进行了表征，并且许多相关的 cDNA 已被克隆。预计不同的 TAF 会介导各种基因启动子和 RNA 聚合酶的不同转录激活子的功能。
▼ 克隆和表达
Mengus 等人（1995） 设计了源自纯化 TAFII18 亚基序列的简并寡核苷酸探针，并用它们分离出编码 16.5 kD 的 124 个氨基酸蛋白质的 cDNA，与胰蛋白酶肽序列一致。他们分离出了编码 TAF2K（也称为 TAFII18）的基因，该基因与酵母蛋白 FUN 81（其功能未知）有 28% 的同一性。作者证明，TAFII18 通过不同的结构域与 TBP 相互作用，但它与 TAFII28（TAF11; 600772） 和 TAFII30（TAF2H; 600475） 的相互作用更强。
▼ 生化特征
晶体结构
伯克等人（1998） 确定了人 TBP 相关因子 TAFII28/TAFII18 异二聚体的晶体结构，并表明这些 TAFII 在 TFIID 复合物中形成新的组蛋白样对。TAFII28 和 TAFII18 中的组蛋白折叠不是从其一级序列预测的，表明这些 TAFII 定义了一个新的非典型组蛋白折叠序列家族。
▼ 测绘
国际辐射混合定位联盟将 TAF13（TAF2K） 基因定位到 1 号染色体（SHGC-64750）。
▼ 分子遗传学
Tawamie 等人在来自 2 个无关近亲家庭的 4 名患有常染色体隐性遗传性精神发育迟滞 60（MRT60; 617432） 的患者中（2017） 鉴定了 TAF13 基因中的纯合错义突变（M40K, 600774.0001 和 L31H, 600774.0002）。这些突变是通过纯合性作图和外显子组测序相结合发现的，并通过桑格测序得到证实。在两个家族中，这些突变都随着疾病的发生而分离。将突变转染到 HeLa 细胞中表明，两种突变 TAF13 蛋白与 TAF11（600772） 的相互作用均减少，从而损害了功能性异二聚体的形成。M40K突变比L31H突变具有更有害的影响，这与M40K突变患者更严重的表型一致。在人神经母细胞瘤细胞中使用 siRNA 敲低 TAF13 基因，导致涉及运动、迁移、增殖、形态、突起形成和分化的基因转录失调。这些变化影响神经元发育和增殖以及神经突发生。与对照组相比，敲除 TAF13 的神经元细胞显示出增殖增加和分化改变。研究结果强调了 TAF13 在神经元发育中的作用。
▼ 等位基因变异（2 个选定示例）：.
0001 精神发育迟滞，常染色体隐性 60
TAF13、MET40LYS
Tawamie 等人的 2 名同胞，由叙利亚库尔德血统的近亲父母所生，患有常染色体隐性遗传性智力低下 60（MRT60; 617432）（2017） 在 TAF13 基因中鉴定出纯合 c.119T-A 颠换（c.119T-A, NM_005645.3），导致高度保守残基处的 met40 到 lys（M40K） 取代。该突变是通过纯合性作图和外显子组测序相结合发现的，并通过桑格测序得到证实。该突变在家族中随疾病分离，在 1000 个基因组计划、外显子组变异服务器或 ExAC 数据库、380 名叙利亚对照个体或 728 名内部对照外显子组中均未发现该突变。将突变转染到 HeLa 细胞中表明突变 TAF13 与 TAF11 的相互作用减少（600772）。
.0002 精神发育迟滞，常染色体隐性遗传 60
TAF13，LEU31HIS
2 个兄弟，由意大利南部血统的近亲父母所生，患有常染色体隐性遗传精神发育迟滞 60（MRT60；617432），Tawamie 等人（2017） 在 TAF13 基因中鉴定出纯合 c.92T-A 颠换（c.92T-A, NM_005645.3），导致高度保守残基处的 leu31 到 his（L31H） 取代。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的，与家族中的疾病分离。在 1000 个基因组计划、外显子组变异服务器或 ExAC 数据库、380 名叙利亚对照个体或 728 名内部对照外显子组中未发现该突变。将突变转染到 HeLa 细胞中表明突变 TAF13 与 TAF11 的相互作用减少（600772）。
