含 RAD52 基序的蛋白质 1; RDM1
HGNC 批准的基因符号:RDM1
细胞遗传学位置:17q12 基因组坐标(GRCh38):17:35,918,079-35,931,820(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Hamimes 等人通过在数据库中搜索与鸡 Rdm1 相似的序列,然后对睾丸和大脑 cDNA 文库进行 PCR,发现了这一点(2005)克隆了人类RDM1。 推导的 284 个氨基酸蛋白包含一个 N 末端 RNA 识别基序和一个 29 个氨基酸基序(称为 RD 基序),该基序在 RAD52(600392) 中保守。 人 RDM1 与小鼠和鸡 Rdm1 分别具有 71.1% 和 51.2% 的氨基酸同一性。 Northern 印迹分析在睾丸中检测到 1.2 kb RDM1 转录物,但在脾脏、胸腺、前列腺、卵巢、小肠、结肠和外周血白细胞中几乎没有检测到表达。
Messaoudi 等人通过对几种人类细胞系进行 RT-PCR(2007) 鉴定了 11 个编码不同蛋白质亚型的 RDM1 剪接变体。 只有外显子 3 是所有 RMD1 变体所共有的。 使用 2 个翻译起始位点(一个位于外显子 1,另一个位于内含子 1)产生具有长或短 N 末端的 RDM1 同工型,并且 RDM1 同工型在其 C 末端具有很大的多样性。 RDM1 亚型的计算分子量范围为全长蛋白质 RDM1-α 的 31.9 kD 到最短蛋白质 RDM1-δ 的 8.8 kD。 长的 N 端异构体显示出不同的亚细胞分布,范围从主要是细胞质到完全是细胞核。
▼ 基因功能
哈米姆斯等人(2005) 发现 DT40 鸡 B 细胞系中 Rdm1 基因的破坏导致抗癌药物顺铂的敏感性增加 3 倍以上。 然而,Rdm1 -/- 细胞对电离辐射、紫外线照射或烷基化引起的 DNA 损伤并不过敏。 凝胶迁移试验和电子显微镜表明,重组鸡 Rdm1 与单链 DNA 和双链 DNA(dsDNA) 相互作用,并且在体外识别顺铂-DNA 加合物诱导的 DNA 扭曲。 随着浓度的增加,Rdm1 与 dsDNA 组装成丝状结构,从而逐渐形成 DNA 涂层,表明 Rdm1 与 dsDNA 结合具有协同作用。
梅萨乌迪等人(2007) 发现蛋白酶体抑制诱导荧光标记的人 RDM1-α 的亚细胞重新分布及其核仁积累成圆形或更缠绕的结构。 在正常条件下,RDM1-α 似乎与 PML(102578) 小体和 Cajal 核体相互作用,并且这些关联随着蛋白毒性应激而增加。 在轻度热休克期间观察到类似的 RDM1-α 重新分布,并且热休克引起的重新分布是可逆的。 RT-PCR 分析表明,RDM1 的表达受到热休克的调节,一些 RDM1 变体上调,而其他变体下调。 所有长 N 端 RDM1 亚型均表现出响应热休克或蛋白毒性应激的核仁积累。 Messaoudi 等人使用突变分析(2007) 鉴定了所有 RDM1 亚型共有的核和核仁定位信号。 他们还在 RDM1-α 的 C 端一半中鉴定了一个细胞质保留结构域和一个参与应激诱导核仁积累的结构域。
▼ 基因结构
梅萨乌迪等人(2007)确定RDM1基因包含7个编码外显子。 另一个翻译起始密码子位于内含子 1 内。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Hamimes 等人(2005) 将 RDM1 基因定位到染色体 17q11.2。