SHC 转化蛋白 2; SHC2
- SHC 蛋白 B; SHCB
- SHC 样蛋白 SCK; SCK
- SHC 转换因子同系物,神经元
HGNC 批准的基因符号:SHC2
细胞遗传学位置:19p13.3 基因组坐标(GRCh38):19:416,588-461,032(来自 NCBI)
▼ 说明
Src 同源 2(SH2) 结构域与参与生长因子和细胞因子受体信号转导的酪氨酸磷酸化蛋白特异性结合(卡瓦诺和威廉姆斯总结,1994)。
▼ 克隆与表达
在 SHC1 蛋白(600560) 中,Kavanaugh 和 Williams(1994) 鉴定了一个不同于 SH2 结构域的序列,他们将其称为磷酸酪氨酸结合(PTB) 结构域。 SHC1 的 PTB 结构域特异性结合酪氨酸磷酸化的 145 kD 蛋白 INPP5D(601582)。 通过使用编码推定的包含 PTB 结构域的蛋白质的 EST 作为探针筛选胎盘和肝癌 cDNA 文库,Kavanaugh 和 Williams(1994) 鉴定了编码 SCK(SHC 样)的部分 cDNA。 他们确定 SCK 蛋白同时含有 PTB 和 SH2 结构域。 Northern印迹分析表明,与SHC1在脑中普遍表达但表达量非常低不同,SCK在肝脏中的表达高于其他组织,并且在脑中表达。
Nakamura 等人通过 RT-PCR,然后筛选额叶皮层 cDNA 文库(1998)获得了编码SCK的近全长cDNA。 推导的 489 个氨基酸的 SCK 蛋白包含一个保守的 N 端 PTB 结构域、一个胶原同源(CH) 结构域和一个保守的 C 端 SH2 结构域。 与 SHC1 一样,SCK 包含独特的富含脯氨酸的基序,可能是 SH3 识别位点。 Northern 印迹分析检测到大约 2.7 kb SCK 转录物的广泛表达,在肝脏、胰腺、前列腺和卵巢中表达最高,在大脑中表达中等。 作者确定 NSHC(605263) 是一种神经元 SHC 同源物,主要在大脑中表达,仅在胰腺中检测到微弱表达。 在大脑区域内,NSHC 在大脑皮层、额叶和颞叶、枕极、海马、尾状核和杏仁核中大量表达,而在小脑、延髓和脊髓中表达极低或无表达。 SCK 的表达与 NSHC 的表达部分重叠,只是 SCK 在下丘脑中表达较高,在尾状核中表达很低,而 NSHC 在尾状核中表达丰富,在下丘脑中表达较弱。 大鼠周围神经系统原位杂交分析显示SCK和SHC1均高表达,而NSHC表达很低。 免疫印迹分析确定表皮生长因子(EGF; 131530) 信号传导由 SCK 和 NSHC 介导。 免疫共沉淀分析显示,与 NSHC 相比,SCK 与神经营养受体 TRKA(191315) 和 TRKB(600456) 的结合较弱。 中村等人(1998) 发现 SCK 与被 Src 酪氨酸激酶磷酸化的 135-kD 蛋白质特异性相关(参见 124095)。
▼ 细胞遗传学
Sasaki 等人使用全基因组拷贝数变异(CNV) 微阵列分析一对多系统萎缩不一致的同卵双胞胎(MSA; 146500)(2011) 发现受影响的双胞胎染色体 19p13.3 的亚端粒有一个 350 kb 的杂合性缺失,而在未受影响的双胞胎中没有看到这种变化。 全基因组 CNV 分析发现,31 名不相关的 MSA 患者中有 10 名(30%)存在该区域的杂合性缺失,尽管每位患者的断点不同。 在总共 125 名个体的 2 个对照队列中未发现该区域的 CNV,比值比(OR) 为 8.98(p = 1.04 x 10(-8))。 在这对双胞胎中发现的区域包含 4 个基因,其中包括 SHC2; SHC2 在受影响的双胞胎和 19p 缺失的 MSA 患者中被删除,表明它可能是易患该疾病的候选基因。