具有序列相似性的家族58,成员A; FAM58A
HGNC 批准的基因符号:CCNQ
细胞遗传学位置:Xq28 基因组坐标(GRCh38):X:153,587,924-153,599,164(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
昂格尔等人(2008) 在对患有一系列面部畸形和畸形(称为 STAR 综合征)的个体的基因组缺失分析中发现了 FAM58A 基因(300707)。 642 bp 编码区编码 214 个氨基酸的蛋白质。 利用 EST 数据,作者发现 FAM58A 基因在 48 个成人组织中的 27 个组织中表达,包括肾脏、结肠、子宫颈和子宫,但不包括心脏。 在黑猩猩和狗的X染色体上发现了与FAM58A同源的基因; 在小鼠和大鼠中,没有发现真正的同源物。 FAM58A 包含细胞周期蛋白框折叠结构域,这是一种在细胞周期蛋白中发现的蛋白质结合结构域,在细胞周期和转录控制中发挥作用。 免疫共沉淀测定表明,FAM58A 与 SALL1(602218) 相互作用,但不与 SALL4(607343) 相互作用,表明 FAM58A 和 SALL1 参与相同的发育途径。 在 HEK293 细胞中通过 RNA 干扰(RNAi) 敲低 FAM58A mRNA 导致 FAM58A mRNA 表达和转染细胞增殖显着减少。
▼ 基因结构
昂格尔等人(2008)确定FAM58A基因有5个编码外显子。
▼ 测绘
FAM58A 位于染色体 Xq28 上 MECP2(300005) 约 0.56 Mb 着丝粒处(Unger 等,2008)。
▼ 分子遗传学
Unger 等人在 2 名患有肛门生殖器和肾脏畸形、面部特征畸形、智力正常和脚趾并指畸形的女性中(STAR; 300707)(2008) 检测到 FAM58A 基因区域的基因组缺失。 在另外 4 名受影响的女性中,作者发现了 3 种不同的杂合点突变。 Green 等人报告了其中两名患者,一对母女(1996)。
Lefroy 等人对一名患有 STAR 综合征的 19 岁女性进行了研究(2017) 发现了 FAM58A 基因的杂合缺失。 她的母亲只有双侧 4-5 个脚趾并指,被发现有大约 50% 的嵌合性缺失。
▼ 等位基因变异体(5 个精选示例):
.0001 明星综合症
FAM58A,40-KB DEL
Unger 等人在一名患有 STAR 综合征(STAR;300707)且具有下眼睑缺损、癫痫和脊髓空洞症其他特征的女孩中,进行了研究(2008) 在染色体 Xq28 上发现了约 40 kb 的杂合缺失,该缺失去除了外显子 1 和 2 以及内含子 1、内含子 2 的一部分以及 FAM58A 基因的 5 引物非翻译区。
.0002 明星综合症
FAM58A、4249-BP 删除
Unger 等人在一名患有 STAR 综合征(STAR;300707)的女孩中(2008)检测到 4,249 bp 的从头杂合缺失,去除了内含子 4 的 1,265 bp、所有外显子 5(包括 FAM58A 基因的 3 素非翻译区)和 3 素序列的 2,454 bp。
.0003 明星综合症
FAM58A、IVS4DS、G-A、+1
Unger 等人在 STAR 综合征(STAR; 300707) 患者中进行了研究(2008) 鉴定了 FAM58A 基因内含子 4(555+1G-A) 中的供体剪接位点突变。
.0004 明星综合症
FAM58A、1-BP DUP、201T
Unger 等人在一名患有 STAR 综合征(STAR;300707)的女孩中(2008) 在 FAM58A 基因中发现了 1 bp 重复(201dupT),导致移码和过早终止密码子(Asn68TerfsTer1)。
.0005 明星综合症
FAM58A、IVS4AS、G-A、-1
在格林等人报道的母女中(1996) 患有 STAR 综合征(STAR; 300707),Unger 等人(2008) 在 FAM58A 基因 556-1G-A 中发现了一个突变,它改变了内含子 4 的剪接受体位点。