古代普遍存在的蛋白质 1; AUP1
HGNC 批准的基因符号:AUP1
细胞遗传学定位:2p13.1 基因组坐标(GRCh38):2:74,526,651-74,529,705(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
在寻找小鼠 6 号染色体上微卫星标记 D6Mit5 和 D6Mit21 之间的基因时,Jang 等人(1996) 在动物园印迹上发现了一个非重复的 0.7-kb 片段,它与人类、猫和狗的 DNA 杂交。 他们使用该片段作为探针,从小鼠新生儿大脑和成年小鼠睾丸 cDNA 文库中克隆了 cDNA。 张等人(1996) 对重叠的 cDNA 进行了测序,发现了一个 410 个氨基酸的开放解读码组,在 N 末端具有假定的分泌信号序列,以及一个与 ARCN1 基因(600820) 的“古代保守区”同源的结构域。 他们将新基因命名为AUP1。 小鼠 Northern 印迹分析显示,在所有测试的成人组织以及胚胎第 10 天至 14 天的胎儿样本中都有一个 1.5-kb Aup1 转录物。通过数据库分析,Jang 等人(1996) 揭示了秀丽隐杆线虫同源物、假设蛋白 F44b9 的存在,该蛋白与小鼠 Aup1 具有 35% 的氨基酸同一性。 Jang 等人利用大量重叠的 EST 序列(1996) 鉴定了小鼠 Aup1 的人类同源物。
斯潘德尔等人(2011) 报道,410 个氨基酸的人 AUP1 蛋白包含一个长的 N 端疏水性延伸段,随后是一个酰基转移酶结构域、一个泛素与内质网相关降解(CUE) 结构域的偶联,以及一个 C 端 G2(UBE2G2; 603124) 结合区(G2BR)。 对人类和其他哺乳动物细胞系的免疫荧光分析将 AUP1 定位于脂滴表面和内质网(ER)。
▼ 基因功能
Mueller 等人使用人类细胞系(2008) 鉴定了错误折叠蛋白质从内质网腔到胞质溶胶进行蛋白酶体依赖性降解的逆转位或错位所需的蛋白质复合物的几种成分。 其中包括 SEL1L(602329)、HRD1(SYVN1; 608046)、derlin-2(DERL2; 610304)、ATPase p97(VCP; 601023)、PDI(P4HB; 176790)、BIP(HSPA5; 138120)、calnexin(CANX; 114217)、AUP 1、UBXD8(FAF2)、UBC6E(UBE2J1;616175) 和 OS9(609677)。
Spandl 等人使用差异溶解和蛋白酶消化(2011)表明AUP1蛋白的N端疏水性延伸在脂滴表面形成发夹结构,N端和C端均面向细胞质。 可溶形式的重组人 AUP1 和分离的 G2BR 结构域结合 E2 泛素缀合酶 Ube2g2,但不结合 Ube2g1(601569)。 免疫亲和层析证实了 AUP1 和 Ube2g2 之间的相互作用,并表明 AUP1 自身结合。 含有 G2BR 结构域突变或缺失的全长 AUP1 不结合 Ube2g2。 斯潘德尔等人(2011) 假设脂滴中的 AUP1,或许在 ER 中,通过招募 UBE2G2 在泛素介导的蛋白质降解中发挥作用。
▼ 测绘
通过 YAC 重叠群分析,Jang 等人(1996) 将人类 AUP1 基因定位到染色体 2p13。