溶质载体家族25(线粒体载体、磷酸盐载体),成员24; SLC25A24
- 短钙结合线粒体载体 1;SCAMC1
HGNC 批准的基因符号:SLC25A24
细胞遗传学定位:1p13.3 基因组坐标(GRCh38):1:108,134,042-108,200,342(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
del Arco 和 Satrustegui(2004) 通过使用兔过氧化物酶体载体 Efinal 作为查询搜索 EST 数据库,然后对心脏 cDNA 文库进行 PCR,并对 HEK293 细胞总 RNA 进行 RT-PCR,克隆了 SLC25A24,并将其命名为 SCAMC1。推导的 477 个氨基酸的蛋白质包含一个 N 端钙结合结构域,后面是 6 个跨膜区和一个短的 C 端。钙结合结构域与钙调蛋白有 25% 的同一性(参见 114180),在保守位置有 4 个 EF-hand 基序。SCAMC1 还与 SCAMC2(SLC25A25; 608745) 和 SCAMC3(SLC25A23; 608746) 具有显着相似性,其中 N 末端和 EF-hand 1 差异最大。Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 3.4 kb SCAMC1 转录物,并且 SCAMC1 的表达通常高于 SCAMC2 或 SCAMC3。内源性和转染的表位标记的 SCAMC1 均以与线粒体标记重叠的亚细胞模式表达。对许多细胞系的线粒体富集部分进行的蛋白质印迹分析表明,SCAMC1 以 48 至 50 kD 的表观分子质量进行迁移。
▼ 基因结构
Del Arco和Satrustegui(2004)确定SLC25A24基因包含10个外显子,跨度约65 kb。小鼠 Slc25a24 基因具有相同的基因组结构。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,del Arco 和 Satrustegui(2004) 将 SLC25A24 基因定位到染色体 1p36.13。他们将小鼠 Slc25a24 基因定位到 2B 号染色体的一个区域,该区域显示出与人类染色体 1p36.13 同线性的同源性。
▼ 分子遗传学
Ehmke 等人在 5 名患有 Fontaine 早衰综合征(FPS;612289)的无关女孩中,其中 1 人在 20 个月大时死亡(2017) 鉴定了 SLC25A24 基因中 2 种不同的从头错义突变的杂合性,这两种突变都发生在相同的密码子处:4 名患者中出现 R217H(608744.0001),1 名患者中出现 R217C(608744.0002)。
Writzl 等人在 4 名无关的 FPS 患者中,全部在出生后一年内死亡(2017) 鉴定了 SLC25A24 基因 R217 密码子处相同的 2 个从头错义突变的杂合性,这与 Ehmke 等人之前报道的相同(2017):其中 3 名患者携带 R217H 变异,1 名患者携带 R217C 变异。功能分析表明,这些突变明显影响线粒体形态,还表明通过减少 ATP 合成和增加线粒体膜电位来影响氧化磷酸化,从而创造不利于细胞增殖的条件。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):.
0001 FONTAINE 早衰综合症
SLC25A24、ARG217HIS(SCV000320993)
4 名不相关的女孩患有 Fontaine 早衰综合征(FPS; 612289),其中包括一名最初由 Adolphs 等人报道的匈牙利女孩(2011),埃姆克等人(2017) 鉴定了 SLC25A24 基因外显子 5 中从头 c.650G-A 转变(c.650G-A, NM_013386.4) 的杂合性,导致跨膜结构域的预测螺旋 1 中高度保守的残基处 arg217 到 his(R217H) 取代。ExAC、gnomAD 或 1000 基因组计划数据库中未发现该突变。其中 2 名患者(患者 1 和 4)的皮肤成纤维细胞显示线粒体肿胀,在用 H2O2 治疗诱导氧化应激后,线粒体肿胀,而对照成纤维细胞几乎没有变化;这些发现得到了透射电子显微镜的证实。在转染的 HeLa 细胞中,野生型和突变型蛋白均定位于线粒体,但突变型存在线粒体肿胀和断裂增加,这在用 H2O2 处理后更为明显。正常情况下患者成纤维细胞线粒体膜电位(MMP)未见异常;然而,用 H2O2 处理后,突变成纤维细胞中的 MMP 似乎高于对照细胞,表明质子梯度发生了变化。使用萤火虫荧光素酶(一种 ATP 依赖性酶)对线粒体基质的 ATP 含量进行分析表明,患者成纤维细胞的萤火虫活性降低,这与基质 ATP 含量降低一致。其中 3 名患者在上次检查时还活着,年龄分别为 5 岁、5.5 岁和 7 ,但 1 名患者(患者 4)是一名土耳其女孩,在 20 个月大时因尿路感染死亡。但突变体出现线粒体肿胀和碎片增加,这在用 H2O2 处理后更加明显。正常情况下患者成纤维细胞线粒体膜电位(MMP)未见异常;然而,用 H2O2 处理后,突变成纤维细胞中的 MMP 似乎高于对照细胞,表明质子梯度发生了变化。使用萤火虫荧光素酶(一种 ATP 依赖性酶)对线粒体基质的 ATP 含量进行分析表明,患者成纤维细胞的萤火虫活性降低,这与基质 ATP 含量降低一致。其中 3 名患者在上次检查时还活着,年龄分别为 5 岁、5.5 岁和 7 ,但 1 名患者(患者 4)是一名土耳其女孩,在 20 个月大时因尿路感染死亡。但突变体出现线粒体肿胀和碎片增加,这在用 H2O2 处理后更加明显。正常情况下患者成纤维细胞线粒体膜电位(MMP)未见异常;然而,用 H2O2 处理后,突变成纤维细胞中的 MMP 似乎高于对照细胞,表明质子梯度发生了变化。使用萤火虫荧光素酶(一种 ATP 依赖性酶)对线粒体基质的 ATP 含量进行分析表明,患者成纤维细胞的萤火虫活性降低,这与基质 ATP 含量降低一致。其中 3 名患者在上次检查时还活着,年龄分别为 5 岁、5.5 岁和 7 ,但 1 名患者(患者 4)是一名土耳其女孩,在 20 个月大时因尿路感染死亡。用H2O2处理后这种现象更加明显。正常情况下患者成纤维细胞线粒体膜电位(MMP)未见异常;然而,用 H2O2 处理后,突变成纤维细胞中的 MMP 似乎高于对照细胞,表明质子梯度发生了变化。使用萤火虫荧光素酶(一种 ATP 依赖性酶)对线粒体基质的 ATP 含量进行分析表明,患者成纤维细胞的萤火虫活性降低,这与基质 ATP 含量降低一致。其中 3 名患者在上次检查时还活着,年龄分别为 5 岁、5.5 岁和 7 ,但 1 名患者(患者 4)是一名土耳其女孩,在 20 个月大时因尿路感染死亡。用H2O2处理后这种现象更加明显。正常情况下患者成纤维细胞线粒体膜电位(MMP)未见异常;然而,用 H2O2 处理后,突变成纤维细胞中的 MMP 似乎高于对照细胞,表明质子梯度发生了变化。使用萤火虫荧光素酶(一种 ATP 依赖性酶)对线粒体基质的 ATP 含量进行分析表明,患者成纤维细胞的萤火虫活性降低,这与基质 ATP 含量降低一致。其中 3 名患者在上次检查时还活着,年龄分别为 5 岁、5.5 岁和 7 ,但 1 名患者(患者 4)是一名土耳其女孩,在 20 个月大时因尿路感染死亡。用 H2O2 处理后,突变型成纤维细胞中的 MMP 似乎高于对照细胞,表明质子梯度发生了变化。使用萤火虫荧光素酶(一种 ATP 依赖性酶)对线粒体基质的 ATP 含量进行分析表明,患者成纤维细胞的萤火虫活性降低,这与基质 ATP 含量降低一致。其中 3 名患者在上次检查时还活着,年龄分别为 5 岁、5.5 岁和 7 ,但 1 名患者(患者 4)是一名土耳其女孩,在 20 个月大时因尿路感染死亡。用 H2O2 处理后,突变型成纤维细胞中的 MMP 似乎高于对照细胞,表明质子梯度发生了变化。使用萤火虫荧光素酶(一种 ATP 依赖性酶)对线粒体基质的 ATP 含量进行分析表明,患者成纤维细胞的萤火虫活性降低,这与基质 ATP 含量降低一致。其中 3 名患者在上次检查时还活着,年龄分别为 5 岁、5.5 岁和 7 ,但 1 名患者(患者 4)是一名土耳其女孩,在 20 个月大时因尿路感染死亡。
在 3 名无血缘关系的 FPS 婴儿中,包括一名斯洛文尼亚男婴(患者 1)、一名法国女婴(患者 2),最初由 Faivre 等人报道(1999),以及 Castori 等人之前描述的一名意大利男性新生儿(患者 4)(2009),Writzl 等人(2017) 在完全保守的线粒体载体家族(MCF) 特征中,在位于载体 m 门正下方的残基处鉴定了 SLC25A24 中 R217H 突变的杂合性。在斯洛文尼亚外显子组数据库或 dbSNP(版本 141)、gnomAD、GoNL 或 UK10K 数据库中未发现该突变。患者成纤维细胞显示突变蛋白定位于线粒体,线粒体增大且靠近细胞核肿胀;电子显微镜显示出异常的嵴,肿胀的线粒体中的嵴比正常线粒体中的嵴更大、更致密。HeLa 和 COS-7 细胞中 R217H 突变体的过度表达显示线粒体异常肿胀,与患者成纤维细胞中观察到的情况相似;然而,与患者成纤维细胞相反,整个线粒体网络似乎受到均匀影响。这名意大利男性新生儿在出生后 20 小时内因呼吸窘迫死亡,另外 2 名患者分别在 6 个月和 7 个月大时死于肺动脉高压和败血症。
.0002 FONTAINE 早衰综合征
SLC25A24、ARG217CYS(SCV000320994)
Ehmke 等人在一名患有 Fontaine 早衰综合征(FPS; 612289) 的北欧血统 14 岁女孩(患者 5)中进行了研究(2017) 鉴定了 SLC25A24 基因外显子 5 中从头 c.649C-T 转变(c.649C-T, NM_013386.4) 的杂合性,导致跨膜结构域的预测螺旋 1 中高度保守的残基处 arg217 到 cys(R217C) 取代。ExAC、gnomAD 或 1000 基因组计划数据库中未发现该突变。
一名患有 FPS 的西班牙女性新生儿(患者 3)最初由 Rodriguez 等人描述(1999) 并在生命 7 小时内死于呼吸窘迫,Writzl 等人(2017) 鉴定了 SLC25A24 中 R217C 突变的杂合性,该突变位于完全保守的 MCF 特征内、位于载体 m 门正下方的残基处。在斯洛文尼亚外显子组数据库或 dbSNP(版本 141)、gnomAD、GoNL 或 UK10K 数据库中未发现该突变。HeLa 和 COS-7 细胞中 R217C 突变体的过度表达显示线粒体异常肿胀。表达 R217C 突变体的 HeLa 细胞显示出比野生型细胞更低的蛋白质水平,并且获得频率较低,表明 R217C 对细胞活力有不利影响。使用 xCELLigence 生物传感器系统证实了这一点,结果表明,突变型 HeLa 细胞的细胞指数低于野生型细胞,并且突变型细胞的细胞增殖率低于对照细胞。此外,表达 R217C 的 HeLa 细胞系和患者成纤维细胞的基础线粒体膜电位高于对照细胞,并且 R217C 突变体的 ATP 合成对基础线粒体呼吸的贡献明显低于野生型,表明线粒体超极化与突变体线粒体的 ATP 合成受损有关。寡霉素抑制后线粒体 ATP 的分析与突变细胞中 ATP 需求增加一致,表明 R217C 突变的主要作用不是减少 ATP 需求,而是减少线粒体 ATP 产生,从而增加膜电位。