核糖体蛋白 S10; RPS10
HGNC 批准的基因符号:RPS10
细胞遗传学位置:6p21.31 基因组坐标(GRCh38):6:34,417,453-34,426,068(来自 NCBI)
▼ 描述
哺乳动物核糖体是 4 种 RNA(参见 180450)和大约 80 种不同蛋白质(参见 180466)的大分子组装体。
▼ 克隆和表达
Adams 等人(1992) 分离出 RPS10 cDNA 作为人脑 EST。
Frigerio 等人通过从人类结直肠 cDNA 文库中随机选择 cDNA 的部分序列来搜索序列数据库(1995) 鉴定了编码大鼠核糖体蛋白 S5(RPS5; 603630)、S9(RPS9; 603631)、S10(RPS10)、S29(RPS29; 603633)、L5(RPL5; 603634)、L21(RPL21; 603636)、L27a(R PL27A;603637)和 L28(RPL28;603638)。弗里杰里奥等人(1995) 完成了这些人类核糖体蛋白的 cDNA 序列。推导的人 RPS10 的 165 个氨基酸与大鼠 Rps10 相差 2 个氨基酸;两种蛋白质均不含半胱氨酸残基。Northern印迹分析表明,与邻近正常组织相比,结直肠癌中RPS10的表达存在差异,但没有发现表达水平与疾病严重程度之间存在相关性。
▼ 基因结构
Boria 等人(2010) 指出 RPS10 基因包含 6 个外显子,跨度为 8.65 kb。
▼ 测绘
通过体细胞杂交和辐射杂交作图分析,Kenmochi 等人(1998) 将人类 RPS10 基因定位到染色体 6p。
博里亚等人(2010) 指出 RPS10 基因对应到染色体 6p21.31。
▼ 基因功能
使用 HeLa 细胞中的 siRNA 敲低来分析 RPS10 在 rRNA 前处理中的作用,Doherty 等人(2010) 发现 RPS10 的耗尽导致 18S rRNA 水平下降,表明 RPS10 对于小亚基的产生是必需的。RNA印迹分析显示43S、26S和18S-E前rRNA的积累,与18S rRNA两端的切割缺陷一致。
▼ 分子遗传学
Doherty 等人(2010) 对 117 名 Diamond-Blackfan 贫血患者(参见 DBA9, 613308) 的 35 个核糖体蛋白基因进行了测序,这些患者的 7 个已知 DBA 基因突变呈阴性,并在 5 名患者中鉴定出 RPS10 基因(603632.0001-603632.0003) 中的 3 个突变。
▼ 等位基因变异体(3 个选定示例):
.0001 DIAMOND-BLACKFAN 贫血 9
RPS10、MET1ILE
在一名患有 Diamond-Blackfan 贫血(613308) 的男性患者中,Doherty 等人(2010) 鉴定了 RPS10 基因外显子 1 中 3G-A 转变的杂合性,导致 met1 到 thr(M1T) 取代,消除了起始密码子,预计会产生截短的 144 个残基蛋白质。至少 520 条对照染色体中未发现突变。
.0002 DIAMOND-Blackfan 贫血 9
RPS10,1-BP INS,260C
Doherty 等人在一名 2 个月大时被诊断患有 Diamond-Blackfan 贫血(613308) 的女性患者中(2010) 鉴定了 RPS10 基因外显子 3 中 1 bp 插入(260insC) 的杂合性,导致移码和提前终止密码子。在她未受影响的父亲或至少 520 条对照染色体中未发现该突变。
.0003 DIAMOND-BLACKFAN 贫血 9
RPS10,ARG113TER
在一名患有 Diamond-Blackfan 贫血的男性和 2 名女性先证者(613308) 中,Doherty 等人(2010) 鉴定了 RPS10 基因外显子 4 中 337C-T 转变的杂合性,导致 arg113 到 ter(R113X) 的取代。其中两名患者对类固醇治疗有反应;第三个是一名在出生时被诊断出患有新生突变的女性,她对类固醇治疗没有反应,并且还被发现有蹼状的颈部。至少 520 条对照染色体中未发现突变。
杰拉德等人(2013) 在一名患有 DBA 的 4 岁女孩的 RPS10 基因中发现了 R113X 突变。在她的父母身上没有发现这种突变,这表明它是从头发生的。