白血病,急性淋巴细胞白血病,易感性,2; ALL2
- 白血病,急性淋巴细胞,易感性,2
细胞遗传学定位:7p12.2 基因组坐标(GRCh38):7:49,000,000-50,500,000
▼ 正文
有关急性淋巴细胞白血病易感性遗传异质性的讨论,请参见 ALL1(613065)。
▼ 测绘
Trevino 等人在一项针对 317 名 ALL 患者和 17,958 名对照者的全基因组关联研究中(2009) 发现 ALL 与染色体 7p12.2 上的 3 个 SNP 之间存在关联。 它们处于连锁不平衡状态,位于 IKZF1 基因(603023)(rs11978267,p = 8.8 x 10(-11)) 和 DDC 基因(107930)(rs2167364,p = 2.8 x 10(-6) 和 rs2242041,p = 9.9 x 10(-7)) 中。 特雷维诺等人(2009) 得出结论,种系变异可以影响 ALL 和特定 ALL 亚型的易感性和特征。
Papaemmanuil 等人在一项针对 2 个病例对照系列(总计 907 名 ALL 病例和 2,398 名对照)的全基因组关联研究中(2009) 发现 ALL 与 IKZF1 基因中染色体 7p12.2 上的 SNP 之间存在显着关联(rs4132601,OR 为 1.69,p = 1.20 x 10(-19))。 当仅限于 B 细胞 ALL 时,这种关联也非常显着(OR 为 1.73,p = 9.31 x 10(-20))。 体外研究表明,IKZF1 mRNA 表达与基因型呈剂量依赖性显着相关,较低表达与 C 风险等位基因相关。 作者指出,Ikaros 蛋白是淋巴细胞发育的主要调节因子。
Prasad 等人对来自德国和英国的 1,384 例前体 B 细胞儿童 ALL 病例和 1,877 例对照进行了基因分型(2010) 发现 IKZF1 SNP rs4132601 与 ALL 之间存在显着关联(OR 为 1.69,p = 7.51 x 10(-22))。 这一发现复制了 Trevino 等人之前报道的染色体 7p12.2 上 ALL 的易感位点(2009) 和 Papaemmanuil 等人(2009)。
▼ 分子遗传学
体细胞突变
费城染色体是一种编码 BCR-ABL1 的染色体异常(参见 151410、189980),是慢性粒细胞白血病(CML;608232) 和急性淋巴细胞白血病(ALL) 的一个亚型的典型病变。 为了定义与 BCR-ABL1 协同诱导 ALL 的致癌病变,Mullighan 等人(2008) 对 304 名 ALL 患者的诊断性白血病样本进行了全基因组分析,其中包括 43 例 BCR-ABL1 B 祖细胞 ALL 和 23 例 CML 病例。 编码转录因子 Ikaros 的 IKZF1 在 83.7% 的 BCR-ABL1 ALL 中被删除,但在慢性期 CML 中则没有。 IKZF1 的缺失也被确定为 CML 转化为 ALL(淋巴母细胞危象)时的获得性病变。 IKZF1 缺失导致单倍体不足、显性失活 Ikaros 亚型表达或 Ikaros 表达完全丧失。 IKZF1 缺失断点的测序表明异常 RAG 介导的重组(参见 179615)是造成缺失的原因。 穆里根等人(2008) 得出结论,导致 Ikaros 功能丧失的基因损伤是 BCR-ABL1 ALL 发展的重要事件。
穆里根等人(2009) 在 221 名 B 细胞急性淋巴细胞白血病儿童中,有 63 名(28.6%) 的白血病细胞中发现了涉及 IKZF1 基因的缺失。 20 名患者的细胞缺失了编码外显子 3 至 6,导致 IKZF1 显性失活形式的表达。 在原始队列和由 258 名患者组成的孤立队列中,IKZF1 缺失与复发和不良反应风险增加相关(p 值范围从小于 0.001 到 0.004)。