tRNA 天冬氨酸甲基转移酶 1; TRDMT1
- DNA甲基转移酶2; DNMT2
HGNC 批准的基因符号:TRDMT1
细胞遗传学定位:10p13 基因组坐标(GRCh38):10:17,137,335-17,202,065(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
在 Dnmt1 无效突变纯合的小鼠胚胎干细胞的 DNA 中持续存在微量 5-甲基胞嘧啶(126375)。 Yoder 和 Bestor(1998) 表明,这种残留的 5-甲基胞嘧啶可能是第二种 DNA 甲基转移酶 Dnmt2 的产物。 Dnmt2 包含诊断 DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶的所有序列基序,但似乎缺乏其他真核甲基转移酶常见的大 N 末端调节结构域。 与 Dnmt1 相比,它更类似于裂殖酵母裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe) 的假定 DNA 甲基转移酶。 Dnmt2 产生多种 mRNA 种类,这些 mRNA 低水平存在于人类和小鼠的所有组织中,并且不限于已知在从头甲基化中活跃的细胞类型。
Van den Wyngaert 等人通过在人类 EST 数据库中搜索与细菌和真核 DNA 甲基转移酶相似的序列,(1998) 确定了 TRDMT1。 推导的 391 个氨基酸蛋白的计算分子量为 45 kD,C 端催化结构域具有 10 个保守基序。 Northern 印迹分析在大多数检查组织中检测到 8、4 和 1.8 kb 的转录本。 在大多数正常组织中表达较弱,在胸腺、甲状腺和睾丸中表达稍高。 在 3 个癌细胞系中检测到高表达。
▼ 基因功能
Goll 等人采用遗传和生化相结合的方法(2006) 表明人类 DNMT2 不会甲基化 DNA,而是甲基化小 RNA。 质谱分析显示该 RNA 是天冬氨酸转移 RNA(tRNA(Asp);TRD),并且 DNMT2 特异性甲基化反密码子环中的 38 号胞嘧啶。 DNMT2 的功能高度保守,人类 DNMT2 蛋白在体外恢复 Dnmt2 缺陷型小鼠、拟南芥和果蝇品系的 tRNA(Asp) 的甲基化,其方式依赖于修饰核苷的预先存在的模式。 戈尔等人(2006) 表明间接序列识别也是真核 DNA 甲基转移酶的一个特征,它可能源自 Dnmt2 样 RNA 甲基转移酶。
法尔克等人(2009) 表明果蝇 Dnmt2 参与体细胞而非种系细胞中的逆转录转座子沉默和端粒完整性。
▼ 基因结构
埃尔-马里等人(2009) 指出 TRDMT1 基因包含 11 个外显子。
▼ 测绘
Yoder 和 Bestor(1998) 将人类 DNMT2 基因对应到一组辐射杂种中的 10p14-p12。
通过荧光原位杂交,Van den Wyngaert 等人(1998) 将 TRDMT1 基因定位到染色体 10p13-p12。
通过荧光原位杂交,Vilain 等人(1998) 将 TRDMT1 基因分配到染色体 10p15.1。