1-磷酸鞘氨醇受体 4; S1PR4
- 内皮分化基因 6; EDG6
- S1P受体4; S1P4
HGNC 批准的基因符号:S1PR4
细胞遗传学定位:19p13.3 基因组坐标(GRCh38):19:3,178,768-3,180,331(来自 NCBI)
▼ 说明
溶血脂介质溶血磷脂酸(LPA) 和 1-磷酸鞘氨醇(S1P) 通过一组称为 EDG 受体的 G 蛋白偶联受体(GPCR) 向细胞发出信号。 一些 EDG 受体(例如 EDG1、601974)是 S1P 受体; 其他(例如 EDG2、602282)是 LPA 受体(Chun 等人,2002 年总结)。
▼ 命名法
春等人(2002) 提出了 LPA 和 S1P 受体的命名方案,该方案与国际药理学联合会(IUP) 指南一致。 根据这些指南,受体应以具有最高效力的天然激动剂的缩写命名,后跟下标阿拉伯指趾。 因此他们建议将代号 EDG6 更改为 S1P4。
▼ 克隆与表达
Graler 等人通过使用衍生自 GPCR 保守区域的简并寡核苷酸进行 PCR(1998) 克隆了编码 EDG6 的分化树突状细胞 cDNA。 预测的 384 个氨基酸的 EDG6 蛋白具有 7 个跨膜结构域。 EDG6 蛋白与小鼠 Edg6 序列同一性为 82%,与人 EDG3(601965) 序列同一性为 46%,与人 EDG1 序列同一性为 44%,与人 EDG4(605110) 序列同一性为 39%,与人 EDG2 序列同一性为 37%。 Northern 印迹分析表明,EDG6 在胎儿和成人淋巴和造血组织、肺和伯基特淋巴瘤细胞系中以 1.7 kb 转录本表达。 通过 Northern blot 分析,Contos 等人(2002) 确定小鼠 Gna15(139314) 和 Edg6(他们将其命名为 Slp4)在所有检查的组织中以相同的相对水平共表达,其中在成年脾和肺中表达最高。 他们推测,由于它们的串联染色体方向以及共表达,这两个基因可能处于相同增强子元件的控制之下,并且蛋白质可能在体内偶联。
▼ 测绘
格拉勒等人(1998)指出,他们的 EDG6 cDNA 的 3-prime 末端与包含二核苷酸重复多态性 D19S120(GenBank X65642) 的短序列相同,Jedlicka 等人将其分配给 19p13.3(1994)。 Graler 等人使用 EDG6 基因特异性引物和 D19S120 扩增子引物对人类基因组 DNA 进行 PCR(1998) 将 EDG6 基因定位于 19p13.3。
▼ 基因结构
康托斯等人(2002)确定EDG6基因是无内含子的。 在小鼠中,Edg6 基因包含 2 个外显子,第一个外显子是非翻译的。 启动子不包含 TATA 框元件。 康托斯等人(2002) 确定在小鼠和人类基因组中,GNA11(139313)、GNA15 和 EDG6 基因串联排列。 人类簇占用80 kb,小鼠簇占用50 kb。