伸蛋白 BC- 和 Polycomb 抑制复合物 2 相关蛋白; EPOP
- 17 号染色体开放解读码组 96; C17ORF96
HGNC 批准的基因符号:EPOP
细胞遗传学位置:17q12 基因组坐标(GRCh38):17:38,671,702-38,674,956(来自 NCBI)
▼ 说明
预计 EPOP 通过充当 Polycomb 抑制复合体 2(PRC2) 和 MYC(190080) 转录模块的瞬时亚基来影响基因表达(Liefke et al., 2016)。
▼ 克隆与表达
贝灵格等人(2016) 指出推导的 369 个氨基酸的小鼠 Epop 蛋白具有一个用于结合 伸蛋白 B(ELOB; 600787) 和 伸蛋白 C(ELOC; 600788) 的 N 端 BC 框,以及一个结合 PRC2 核心亚基 Suz12(606245) 的 C 端结构域。 在培养的小鼠胚胎干细胞(ESC) 的核灶和植入前小鼠胚胎的内细胞团细胞中检测到 Epop。 Epop 表达在小鼠 ESC 分化时和第 4.5 天小鼠胚胎的囊胚晚期阶段下调。 数据库分析揭示了有袋动物和真兽类中的 Epop 直系同源物,但单孔类动物中却没有。
▼ 基因功能
Alekseyenko 等人使用交联和串联亲和纯化(2014) 发现人类 C10ORF12(LCOR; 607698) 和 C17ORF96 与 PCR2 的核心组件 EZH2(601573) 相互作用。 293T 细胞的交互实验证实,C10ORF12 和 C17ORF96 下拉了核心 PRC2 亚基。 然而,在相同的PCR2复合物中未发现C10ORF12和C17ORF96。 C10ORF12 和 C17ORF96 还与 MTF2(609882) 和泛素特异性蛋白酶 USP7(602519) 相互作用,MTF2 与 lys36(H3K36me3) 上三甲基化的组蛋白 H3(参见 602810)结合。 染色质免疫沉淀分析显示 C10ORF12 和 C17ORF96 的全基因组富集域与 EZH2 和 H3K27me3 的富集域密切匹配。
Beringer 等人通过对小鼠 ESC 中与 H3K27me3 相关的蛋白质进行质谱分析(2016) 确定了 Epop 以及 PRC1 和 PRC2 的组件。 内源性 Epop 与 PRC2 核心组件和 Plc2(Mtf2) 相关,但与 Jarid2(601594) 或 Aebp2(617934) 无关,它们是瞬态 PRC2 组件。 免疫沉淀分析表明 Epop 还与 Elob-Eloc 异二聚体相互作用。 Epop 通过其 BC 框与 Elob-Eloc 相互作用,并且 Epop BC 框介导 Elob-Eloc 与 PRC2 的关联。 Elob 的消耗降低了 Epop 蛋白含量。 从小鼠ESC中去除Epop并不会抑制PRC2与靶染色质的结合,但它允许Jarid2与PRC2结合。 Epop 和 Elob-Eloc 均阻碍 PRC2 与其靶基因的结合,导致 PRC2 靶基因的低水平表达。
Liefke 等人使用甘油梯度分级分离与蛋白质印迹和质谱分析(2016) 发现人类 EPOP 在 HeLa-S 细胞和小鼠 ESC 中分离成几个不同的子复合体。 含有EPOP的高分子量级分主要含有PRC2亚基,中间分子量级分主要含有USP7,而低分子量级分主要含有ELOB-ELOC二聚体。 与 Epop 敲除小鼠 ESC 相比,野生型小鼠 ESC 的染色质免疫沉淀测序分析揭示了 Epop 结合模式,该模式与 Myc 和 Polycomb 模块的启动子相关成员相关,但与 Core 模块的增强子相关成员无关。 Epop 峰与 RNA 聚合酶 II 和活性组蛋白标记 H3K4me3 以及 PRC2 成员重叠。 EPOP 还直接与 HeLa-S 和小鼠 ESC 中的 ELOB-ELOC 和 USP7 相互作用,并将 ELOB-ELOC 和 USP7 招募到启动子位点。
▼ 测绘
Hartz(2017) 根据包含 EPOP 基因(GenBank AC006449) 的 BAC 序列与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 EPOP 基因对应到染色体 17q12。