RAS 相关蛋白 RAB9; RAB9
HGNC 批准的基因符号:RAB9A
细胞遗传学定位:Xp22.2 基因组坐标(GRCh38):X:13,689,127-13,710,503(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
RAB 蛋白是调节囊泡转移并驻留在特定细胞内区室的 GTP 酶。 RAB9 已定位于胞吞/胞吐途径的组成部分,并涉及膜受体(例如甘露糖 6-磷酸受体(例如 154540))从早期内体到反式高尔基体网络的再循环。 戴维斯等人(1997) 使用与犬 Rab9 cDNA 序列相匹配的寡核苷酸,通过人 U937 RNA 的 RT-PCR 克隆了 RAB9 cDNA。 RAB9 cDNA 编码 201 个氨基酸的蛋白质,其序列与犬 Rab9 的序列几乎 100% 相同。
▼ 基因功能
在使用反义 RNA 的研究中,Davies 等人(1997) 发现 HeLa 细胞中 RAB9 基因表达的下调会诱导严重的细胞空泡形成,类似于 Chediak-Higashi 综合征患者的成纤维细胞中观察到的表型(214500)。
甘露糖 6-磷酸受体(MPR) 将溶酶体水解酶从高尔基体递送至内体,然后返回高尔基复合体。 TIP47(602702) 识别 MPR 的细胞质结构域,是内体到高尔基体转运所必需的。 卡罗尔等人(2001) 证明 TIP47 以其活性、GTP 结合构象直接与 RAB9 GTPase 结合。 此外,RAB9 增加了 TIP47 与其货物的亲和力。 TIP47 刺激体内 MPR 转运需要功能性 RAB9 结合位点。 因此,卡罗尔等人(2001) 的结论是,胞质货物选择装置可以选择性地募集到特定的细胞器上,并且囊泡出芽可能与活性 RAB GTP 酶的存在相关。
艾瓦齐安等人(2006) 生成了可以结合 RAB5 和 RAB9 效应子的 RAB5(179512)/RAB9 嵌合体,以及可以结合 RAB1 和 RAB9 效应子的 RAB1(179508)/RAB9 嵌合体,并检查了效应子结合对 RAB 定位的作用。 在这两种情况下,改变 RAB9 效应子 TIP47 的细胞浓度将一部分蛋白质从其亲代 RAB 定位转移到 RAB9 定位。 他们得出的结论是,效应蛋白和 RAB 相互依赖才能实现正确的稳态定位。
肠沙门氏菌是一种细胞内细菌病原体,通过易位到宿主细胞中的效应蛋白的作用在膜结合液泡内复制。 沙门氏菌液泡具有溶酶体的特征,但由 6-磷酸甘露糖受体(MPR) 转运的水解酶减少。 麦古蒂等人(2012) 发现效应子 SifA 破坏了依赖 Rab9 的 MPR 逆行转移,从而减弱了溶酶体功能。 这需要 SifA 与其宿主细胞靶标 SKIP/PLEKHM2 结合(609613)。 此外,SKIP 调节未感染细胞中 MPR 的逆行转移。 易位的 SifA 与感染细胞中的 SKIP 和 Rab9 形成稳定的复合物。 SifA-SKIP 对 Rab9 的隔离解释了 SifA 对 MPR 转运和溶酶体功能的影响。 溶酶体活性降低的细胞中沙门氏菌的生长增加,溶酶体活性较高的细胞中沙门氏菌的生长减少。 麦古蒂等人(2012) 得出结论,沙门氏菌液泡与溶酶体发生融合,溶酶体的效力已被 SifA 降低。
▼ 测绘
关等人(2000) 报道国际辐射混合图谱联盟将 RAB9 基因图谱到 Xpter 和 DXS1061 标记(sts-R66378) 之间的 Xp22.2 区域的 X 染色体上。
戴维斯等人(1997) 鉴定了一个 RAB9 假基因,其核苷酸序列与 RAB9 的核苷酸序列有 90% 的同一性。 他们通过对体细胞杂交 DNA 进行 PCR 分析,将假基因定位到 5 号染色体上。