钙通道,电压依赖性,γ-6 子单元; CACNG6
HGNC 批准的基因符号:CACNG6
细胞遗传学位置:19q13.42 基因组坐标(GRCh38):19:53,991,148-54,012,665(来自 NCBI)
▼ 说明
电压依赖性钙通道在许多细胞过程中耦合膜去极化。 这些活性受到由成孔 α-1(例如,CACNA1D;114206)亚基和调节性 β(例如,CACNB1;114207)、α-2/δ(例如,CACNA2D1;114204)和 γ(例如,CACNG1;114209)亚基组成的不同通道的调节。
▼ 克隆与表达
Burgess等人通过数据库搜索和分析来自19号染色体PRKCG基因(176980)附近的BAC克隆(2001) 鉴定了编码 CACNG6、CACNG7(606899) 和 CACNG8(606900) 的 cDNA。 推导的 260 个氨基酸的 CACNG6 蛋白在第一个胞外环中包含 4 个跨膜片段和一个高度保守的 N-糖基化位点。 与其他 CACNG 蛋白相比,它具有相对较长的 N 末端。 对 24 个成人和胎儿组织的 RT-PCR 分析检测到除心脏、胎盘和结肠外的所有测试组织中都有 CACNG6 表达。 缺乏外显子 3 的剪接变体的表达主要在小肠、脾脏和脊髓中。 在海马和小脑中检测到缺乏外显子 2 和 3 的变体。
楚等人(2001) 克隆了大鼠、小鼠和人 CACNG6 的 cDNA。 系统发育分析表明,CACNG6 与 CACNG1 最相关,后者也缺乏 PDZ 结合基序。
▼ 基因结构
Burgess 等人通过 RT-PCR 和基因组序列分析(2001) 确定 CACNG6 基因与 CACNG7 和 CACNG8 一样,包含 4 个外显子。 缺乏外显子 3 的潜在剪接变体将消除 2 个跨膜结构域。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Burgess 等人(2001)将CACNG6、CACNG7和CACNG8基因定位到染色体19q13.4,排列为端粒--PRKCG--CACNG7--CACNG8--CACNG6-着丝粒。