HOX 同源基因子家族,成员 1; RHOXF1
- 卵巢、睾丸和附睾表达基因; OTEX
- 同源基因蛋白,PEPP 亚科,1; PEPP1
HGNC 批准的基因符号:RHOXF1
细胞遗传学位置:Xq24 基因组坐标(GRCh38):X:120,109,048-120,117,650(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Geserick 等人通过在数据库中搜索与 PEPP 亚家族的配对样同源基因蛋白相似的序列,然后对卵巢 cDNA 进行 PCR,(2002) 克隆 OTEX。 推导的 184 个氨基酸蛋白质包含特征性的 60 个氨基酸同源框结构域(HD)。 HD 在第 29 位有一个罕见的螺旋断裂脯氨酸,在第 50 位有一个赖氨酸,这是同源框蛋白 DNA 结合特异性所必需的位点。 OTEX 的 HD 与 ESXR1(参见 300154)有 53.3% 的同一性,与 PEPP2(300447)有 45% 的同一性。 RT-PCR检测到卵巢、睾丸和附睾中表达最高,前列腺、乳腺和子宫中表达较弱。 免疫荧光分析揭示了完全的核定位,需要 C 端核定位信号。
小鼠Pem基因位于X染色体上,仅在睾丸、附睾、卵巢和胎盘中表达。 由于Pem的快速进化,很难鉴定人类直系同源物(Lin等人,1994;Maiti等人,1996;Sutton和Wilkinson,1997)。 Wayne等人通过使用小鼠Pem外显子4编码的序列作为诱饵搜索数据库,然后对淋巴细胞白血病细胞RNA进行RT-PCR(2002) 克隆了 OTEX,他们将其命名为 PEPP1。 Northern 印迹分析仅在睾丸中检测到 0.8 kb 的转录物。 RT-PCR 检测到附睾和多种不同来源的肿瘤细胞系中的表达。
麦克莱恩等人(2005) 在小鼠 X 染色体上鉴定出一组 12 个同源框基因,仅在雄性和雌性生殖组织中表达。 这些“生殖同源框 X 连锁”(Rhox) 基因包括 Pem、Psx1 和 Psx2,MacLean 等人(2005) 分别更名为 Rhox5、Rhox6 和 Rhox9。 麦克莱恩等人(2005) 鉴定出人类 PEPP1 和 PEPP2 可能是 1 个或多个 Rhox 基因的直系同源物,但广泛的搜索未能鉴定出与小鼠 Rhox 基因簇同线性的区域中的任何其他人类同源框基因。
▼ 基因功能
格塞里克等人(2002) 发现 OTEX 在表达雄激素受体(313700) 的前列腺细胞系中表达,并且在雄激素治疗后表达增加。 OTEX 在缺乏雄激素受体的相关细胞系中不表达。
▼ 基因结构
格塞里克等人(2002)和韦恩等人(2002) 确定 OTEX 基因有 3 个外显子。 格塞里克等人(2002)发现启动子区域不包含TATA框。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Geserick 等人(2002)和韦恩等人(2002) 将 OTEX 基因(RHOXF1) 对应到染色体 Xq24。 韦恩等人(2002) 指出,该区域与小鼠 X 染色体上包含 Pem、Psx1 和 Psx2(3 个小鼠 PEPP 基因)的区域显示同线性。