SH3 结构域结合富含谷氨酸的蛋白样蛋白 2; SH3BGRL2
- SH3BGR 样蛋白 2
HGNC 批准的基因符号:SH3BGRL2
细胞遗传学位置:6q14.1 基因组坐标(GRCh38):6:79,537,632-79,703,658(来自 NCBI)
▼ 说明
SH3BGRL2 属于硫氧还蛋白(TXN; 187700) 超家族,但它缺乏氧化还原催化活性必需的 CxxC 基序(Mazzocco et al., 2002)。
▼ 克隆与表达
Mazzocco 等人通过在 EST 数据库中搜索与 SH3BGR(602230) 和 SH3BGRL(300190) 相似的序列,然后对 HeLa 细胞总 RNA 进行 RT-PCR(2002)克隆了SH3BGRL2。 转录本的 3-prime UTR 包含多个富含 AU 的降解信号和 2 个聚腺苷酸化位点。 推导的 107 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 12.3 kD。 它与 SH3BGR N 端区域有 63% 的氨基酸同一性,与较短的 SH3BGRL 和 SH3BGRL3(615679) 蛋白分别有 63% 和 39% 的同一性。 SH3BGRL2 具有富含脯氨酸的 C 端序列,具有 SH3 结构域和 HOMER(参见 604798)EVH1 结构域结合基序,其特征是存在硫氧还蛋白样折叠。 然而,SH3BGRL2 缺乏催化活性所需的半胱氨酸。 Northern 印迹分析检测到,在所有检查的人体组织中,SH3BGRL2 转录物的可变表达约为 5 和 3.5 kb,其中脑、胎盘、肝脏和肾脏中的表达最高。 荧光标记的 SH3BGRL2 在转染的 COS-7 细胞的细胞核和核周区域表达。
▼ 基因结构
马佐科等人(2002) 确定 SH3BGRL2 基因包含 4 个外显子,跨度 72 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Mazzocco 等人(2002) 将 SH3BGRL2 基因定位到染色体 6q13-q15。
Gross(2014) 根据 SH3BGRL2 序列(GenBank AF340151) 和基因组序列(GRCh37) 的比对,将 SH3BGRL2 基因对应到染色体 6q14.1。