磷酸甘油酸变位酶家族,成员 5; PGAM5
HGNC 批准的基因符号:PGAM5
细胞遗传学位置:12q24.33 基因组坐标(GRCh38):12:132,710,841-132,722,733(来自 NCBI)
▼ 描述
PGAM5 是磷酸甘油酸变位酶(PGAM) 家族中的一种独特的磷酸水解酶,因为它使蛋白质而不是小分子底物去磷酸化(Takeda 等,2009)。
▼ 克隆与表达
KEAP1(606016) 是 CUL3(603136)-RBX1(603814) 泛素连接酶复合物的接头蛋白,该复合物靶向抗氧化转录因子 NRF2(NFE2L2; 600492),在没有氧化应激的情况下降解。Lo 和 Hannink(2006) 使用质谱分析和数据库分析来鉴定编码 NRF2 以外蛋白(与 MDA-MB-231 乳腺癌细胞系中的 KEAP1 共纯化)的转录本,鉴定了 PGAM5 的 2 个剪接变体。推导的异构体 PGAM5L 和 PGAM5S 分别包含 289 个和 255 个氨基酸,并且前 239 个氨基酸是相同的。两种异构体都有一个 N 端 KEAP1 结合基序和一个预计会结合细胞凋亡调节因子 BCLXL(BCL2L1; 600039) 的区域。PGAM5L 包含与 BCLXL 结合区域重叠的 C 端 PGAM 结构域,而 PGAM5S 在 PGAM 结构域中相对于 PGAM5L 被截短。PGAM5 亚型是 PGAM 家族的远亲成员,催化磷酸组氨酸特征基序的保守性较差。表位标记的 PGAM5L 在转染的 HeLa 和 COS-1 细胞中以弥漫性细胞质和点状核模式表达。PGAMS 显示点状细胞质分布。两种异构体均与 KEAP1 共定位于细胞质中,但在细胞核中未检测到 KEAP1。通过 SDS-PAGE 检测,PGAM5L 的表观分子量为 32 kD。PGAMS 显示点状细胞质分布。两种异构体均与 KEAP1 共定位于细胞质中,但在细胞核中未检测到 KEAP1。通过 SDS-PAGE 检测,PGAM5L 的表观分子量为 32 kD。PGAMS 显示点状细胞质分布。两种异构体均与 KEAP1 共定位于细胞质中,但在细胞核中未检测到 KEAP1。通过 SDS-PAGE 检测,PGAM5L 的表观分子量为 32 kD。
武田等人(2009) 指出 PGAM5 在 N 末端附近有一个跨膜结构域。Pgam5 与小鼠 B16 黑色素瘤细胞的线粒体标记物共分离。
▼ 基因功能
Lo 和 Hannink(2006) 使用蛋白质相互作用测定和突变分析表明,PGAM5L 和 PGAM5S 的 KEAP1 结合基序在 HEK293T 细胞中表达后与 KEAP1 的 Kelch 结构域相互作用。两种亚型也与 BCLXL 相互作用。KEAP1 与 PGAM5L 共表达导致 PGAM5L 泛素化并降低 PGAM5L 半衰期和总蛋白含量。CUL3 和 RBX1 的共表达显着诱导 KEAP1 依赖性 PGAM5L 泛素化,蛋白酶体抑制阻断 KEAP1 依赖性 PGAM5L 降解。氧化应激或用化疗药物异硫氰酸萝卜硫素处理细胞可抑制 KEAP1 依赖性 PGAM5L 泛素化并增加稳态 PGAM5L 蛋白水平。
PGAM通常是中间代谢的糖酵解酶。武田等人(2009)无法检测重组人PGAM5的PGAM活性。相反,PGAM5 使磷酸丝氨酸和磷酸苏氨酸肽去磷酸化,但不使磷酸酪氨酸肽去磷酸化。突变分析表明,PGAM5 的 his105 在反应过程中充当磷酸受体。PGAM5 与细胞凋亡和细胞应激相关激酶 ASK1(MAP3K5; 602448) 相互作用,并通过苏氨酸去磷酸化激活 ASK1,导致下游 JNK(参见 601158) 和 p38(MAPK14; 600289) 激活。过表达和敲低研究表明,PGAM5 的果蝇和线虫直系同源物也表现出特异性丝氨酸/苏氨酸磷酸酶活性,并激活 ASK1 的果蝇和线虫直系同源物。武田等人。
王等人(2012) 确定 PGAM5 在人类细胞系中执行多种坏死途径(但不参与细胞凋亡途径)中发挥作用。在 TNF-α(191160) 诱导坏死后,PGAM5L 和 PGAM5S 均与包含激酶 RIP1(RIPK1; 603453)、RIP3(RIPK3; 605817) 和 MLKL(615153) 的坏死复合物相互作用并被磷酸化。磷酸化的 PGAM5S 随后招募线粒体裂变因子 DRP1(DNM1L;603850),并通过去磷酸化激活 DRP1,导致线粒体断裂和坏死。在该信号级联中的几个点上阻断磷酸化或去磷酸化信号传导,或敲低 PGAM5 表达,可阻断 TNF-α 诱导的坏死。敲低实验表明 PGAM5 同种型和 DRP1,但不是 RIP1、RIP3 或 MLKL,
Sukawara 等人对 Pgam5 -/- 小鼠的棕色脂肪细胞进行 RNA 测序分析(2020) 表明,Pgam5 的缺失会增加 Ucp1(113730) 的表达,Ucp1(113730) 是一种以细胞自主方式增加线粒体能量消耗的蛋白质。Pgam5 消耗也增加了棕色脂肪细胞的耗氧量。Ucp1 表达的负调节需要磷酸酶活性和 Pgam5 的膜内切割。Pisd(612770)(一种线粒体脂质代谢酶)的酶活性是响应线粒体膜电位损失而发生的 Pgam5 裂解所必需的。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Lo 和 Hannink(2006) 将 PGAM5 基因定位到 12 号染色体。
Hartz(2012) 根据 PGAM5 序列(GenBank BC008196) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 PGAM5 基因定位到染色体 12q24.33。