ALG1 壳二酰二磷酸多醇 β-甘露糖基转移酶; ALG1

  • ALG1,酵母,
  • ALG1 天冬酰胺连接糖基化 1 同源物的同系物
  • β-1,4 甘露糖基转移酶
  • HMAT1
  • HMT1

HGNC 批准的基因符号:ALG1

细胞遗传学定位:16p13.3 基因组坐标(GRCh38):16:5,071,824-5,087,378(来自 NCBI)

▼ 描述

脂联寡糖的生物合成在真核生物中高度保守,由 14 种糖基转移酶按顺序逐步催化。甘露糖基转移酶 I(MT I) 催化该过程中的第一个甘露糖基化步骤。

▼ 克隆和表达

通过 EST 数据库搜索酿酒酵母 MT I 基因(ALG1) 并随后筛选人胎脑 cDNA 文库,Takahashi 等人(2000) 分离出了与人类同源物相对应的 cDNA,他们将其称为 HMAT1。HMAT1 编码 464 个氨基酸的蛋白质,与酿酒酵母和线虫基因产物具有 36% 的氨基酸同一性。HMAT1 在 N 末端包含一个疏水区域,后面是短的亲水区域和疏水区域。高桥等人(2000) 证明 HMAT1 补充了由于 ALG1 突变而缺乏功能性 MT I 的酵母菌株的温度敏感表型,表明该酶的功能在酵母和人类之间是保守的。

▼ 测绘

Scott(2000) 根据 MT1 序列(GenBank AB019038) 和 16 号染色体克隆(GenBank AC007011) 之间的序列相似性,将 HMAT1 基因对应到染色体 16p13.3。

▼ 分子遗传学

对于 Ik 型先天性糖基化障碍(608540) 患者,Schwarz 等人(2004) 和克兰兹等人(2004) 发现了 ALG1 基因的突变(605907.0001-605907.0002)。

格鲁本曼等人(2004) 使用荧光方法检测先前未分型的 CDG 患者体内焦磷酸-GlcNAc2 的积累。积累模式表明 ALG1 β-1,4 甘露糖基转移酶缺乏。序列分析确定了 ALG1 基因中 2 个突变的复合杂合性(参见 605907.0003)。

Dupre 等人在 5 名无关的法国 Ik 型 CDG 患者中进行了研究(2010) 鉴定了 ALG1 基因中的纯合或复合杂合突变,包括 7 个新突变(参见,例如 605907.0004-605907.0007)。表型很严​​重,所有患者均出现神经功能障碍,4 例患者出现畸形特征。

Harshman 等人在患有 CDG Ik 和肾病综合征的患者中(2016) 鉴定了先前鉴定的 ALG1 基因(605907.0001) 中 S258L 突变的纯合性。该突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实。

▼ 等位基因变异体(7 个选定示例):

.0001 先天性糖基化障碍,Ik 型
ALG1,SER258LEU(rs28939378)
在患有 Ik 型先天性糖基化障碍(CDG1K;608540) 的患者中,Schwarz 等人(2004) 在 ALG1 基因的外显子 7 中发现了一个纯合的 773C-T 转变,导致了 ser258 到 leu(S258L) 的取代。父母双方都是突变杂合子。

Kranz 等人在患有 CDG Ik 的患者中(2004) 鉴定了 S258L 突变的纯合性。

Harshman 等人在患有 CDG Ik 和肾病综合征的患者中(2016) 鉴定了 S258L 突变的纯合性。

.0002 先天性糖基化障碍,Ik 型
ALG1,GLU342PRO
在患有 Ik 型先天性糖基化障碍(CDG1K;608540) 的患者中,Kranz 等人(2004) 鉴定了 ALG1 基因突变的复合杂合性:1025A-C 颠换,导致 glu342-to-pro(E342P) 取代,以及 S258L(605907.0001)。

.0003 先天性糖基化障碍,Ik 型
ALG1,SER150ARG
在患有 Ik 型先天性糖基化障碍(CDG1K;608540) 的患者中,Grubenmann 等人(2004) 鉴定了 ALG1 基因突变的复合杂合性:外显子 4 中的 450C-G 颠换,导致 Ser150 到 arg(S150R) 取代,以及 S258L(605907.0001)。

.0004 先天性糖基化障碍,Ik 型
ALG1,MET377VAL
在患有 Ik 型先天性糖基化障碍(CDG1K;608540) 的患者中,Dupre 等人(2010) 在 ALG1 基因的外显子 11 中鉴定出纯合的 1129A-G 转换,导致保守残基中的 met377 到 val(M377V) 取代。在 164 个对照等位基因中未发现该突变。对患者细胞系的详细生化研究表明,LLO 生物合成中第二种中间体 GlcNAc2-PP-dolichol 发生积累,并且 MT1 活性存在选择性缺陷(低于野生型的 10%)。该表型很严重,具有神经功能障碍和畸形特征。

.0005 先天性糖基化障碍,Ik
型 ALG1、GLY145ASP
在患有 Ik 型先天性糖基化障碍(CDG1K;608540) 的患者中,Dupre 等人(2010) 鉴定了 ALG1 基因中 2 个突变的复合杂合性:外显子 4 中的 434G-A 转换,导致 gly145 到 asp(G145D) 取代,以及 S258L(605907.0001)。164 个对照等位基因中均未发现突变。对患者细胞系的详细生化研究表明,LLO 生物合成中第二种中间体 GlcNAc2-PP-dolichol 发生积累,并且 MT1 活性存在选择性缺陷(低于野生型的 10%)。该表型很严重,具有神经功能障碍和畸形特征。

.0006 先天性糖基化障碍,Ik 型
ALG1,CYS396TER
在患有 Ik 型先天性糖基化障碍(CDG1K;608540) 的患者中,Dupre 等人(2010) 鉴定了 ALG1 基因中 2 个突变的复合杂合性:外显子 12 中的 1263G-A 转变,导致 cys396-to-ter(C396X) 取代,以及外显子 7 中的 826C-T 转变,导致 arg276-to-trp(R276W; 605907.0007) 取代。在 164 个对照等位基因中未发现突变。对患者细胞系的详细生化研究表明,LLO 生物合成中第二种中间体 GlcNAc2-PP-dolichol 发生积累,并且 MT1 活性存在选择性缺陷(低于野生型的 10%)。该表型很严重,具有神经功能障碍和畸形特征。

.0007 先天性糖基化障碍,Ik 型
ALG1,ARG276TRP
讨论 Dupre 等人在 Ik 型先天性糖基化障碍(CDG1K; 608540) 患者中发现的复合杂合状态的 ALG1 基因中的 arg276-to-trp(R276W) 突变(2010),参见 605907.0006。