IBR 域包含蛋白 3; IBRDC3
- 自然杀伤剂裂解相关分子; NKLAM
HGNC 批准的基因符号:RNF19B
细胞遗传学定位:1p35.1 基因组坐标(GRCh38):1:32,932,497-32,965,265(来自 NCBI)
▼ 说明
IBRDC3 是一种细胞溶解相关的跨膜蛋白,在细胞因子刺激后在自然杀伤(NK) 细胞和 T 淋巴细胞中表达(Kozlowski 等,1999)。
▼ 克隆与表达
Kozlowski 等人通过差异筛选用 IFNB(147640) 刺激的饥饿 IL2(147680) 依赖性 NK 细胞系,以确定与细胞溶解相关的基因,然后进行 PCR(1999) 克隆了 IBRDC3,他们将其称为 NKLAM。 预测的 587 个氨基酸蛋白包含一个潜在的 N 端信号序列,后面是 3 个富含 cys 的结构域(CRD),其中 2 个对应于锌结合 RING 结构域,以及 3 个跨膜序列。 NKLAM 还具有 2 个 N-糖基化位点和多个酰胺化、N-肉豆蔻酰化和磷酸化位点。 NK 细胞的 Northern 印迹分析检测到 2.9-kb NKLAM 转录物。 免疫沉淀和蛋白质印迹分析显示 NK 细胞中表达 65-kD NKLAM 蛋白。 蛋白质印迹分析显示 NKLAM 与颗粒酶 B(GZMB;123910) 共定位于 NK 细胞的溶细胞颗粒中。
波蒂斯等人(2000) 从 NK 细胞 cDNA 文库中克隆了 NKLAM 剪接变体。 该变体编码预测的 731 个氨基酸的蛋白质,计算分子量为 77 kD。 它与小鼠 Nklam 蛋白具有 94% 的氨基酸同一性。 编码 587 个氨基酸的蛋白质的变体不存在于小鼠体内。 RT-PCR 显示两种 NKLAM 变体均在人类 NK 细胞中表达,转录物编码较大的亚型占主导地位。 与人类 NKLAM 一样,小鼠 NKLAM 在 NK 细胞、Cd8(参见 186910)阳性 T 细胞和活化的腹膜巨噬细胞中选择性表达。
▼ 基因功能
Kozlowski 等人使用 Northern blot 分析(1999) 发现与未刺激的细胞相比,NKLAM 的表达在细胞因子刺激的 NK 细胞和单核细胞以及靶刺激的细胞毒性 T 淋巴细胞中上调。 NKLAM 表达在 T 细胞和其他细胞系中较低或检测不到,并且不会因刺激而上调。 动力学分析显示 NKLAM 表达、IFNG(147570) 表达和 NK 细胞的细胞溶解活性之间存在相关性。 用反义 NKLAM 处理 NK 细胞和细胞毒性 T 淋巴细胞可降低其细胞溶解活性。 科兹洛夫斯基等人(1999) 得出结论,NKLAM 表达与杀伤细胞类型的细胞溶解功能相关。
Fortier 和 Kornbluth(2006) 确定 NKLAM 的 CRD 与 E3 连接酶dorfin(607119) 的 CRD 具有显着的同源性。 使用免疫共沉淀结合测定,他们发现NKLAM在转染的人胚胎肾细胞中结合泛素缀合物UBCH7(UBE2L3;603721)和UBCH8(UBE2L6;603890),并且内源性NKLAM和UBCH8在体内NK细胞中相互作用。 酵母 2 杂交、免疫沉淀和突变分析表明,NKLAM 的环指与人胚胎肾细胞中的 URKL1(UCKL1;610866)相互作用。 这种相互作用导致 URKL1 的蛋白质水平降低并泛素化增加。 共聚焦显微镜显示,单独转染时,URKL1 定位于细胞核,NKLAM 定位于外膜附近的细胞质。 然而,URKL1 和 NKLAM 的共转染导致它们在细胞质中共定位。 Fortier 和 Kornbluth(2006) 得出结论,NKLAM 是一种 E3 连接酶,URKL1 是其底物。
▼ 基因结构
波蒂斯等人(2000) 确定 IBRDC3 基因包含 9 个外显子。
▼ 测绘
国际辐射混合测绘联盟将 IBRDC3 基因测绘到 1 号染色体(RH98813)。