色氨酸2,3-双加氧酶; TDO2

  • 色氨酸加氧酶;TRPO

HGNC 批准的基因符号:TDO2

细胞遗传学位置:4q32.1 基因组坐标(GRCh38):4:155,903,695-155,920,405(来自 NCBI)

▼ 描述

色氨酸 2,3-双加氧酶(EC 1.13.11.11) 在催化犬尿氨酸途径(色氨酸代谢的主要途径)的第一步和大鼠限制步骤中发挥作用。

▼ 克隆和表达

Comings 等(1989, 1991) 报道了编码色氨酸加氧酶的人类 cDNA 克隆的鉴定。康明斯等人(1995) 报道人类 TDO2 酶与大鼠 TDO2 酶有 88% 同源性。

▼ 基因结构

Comings 等(1995)报道了TDO2基因的结构。鉴定出十二个外显子。与大鼠相比,人类 TDO2 基因的调控区插入了约 1,064 bp 的随机 DNA,从 -293 bp 开始一直延伸到 -1357 bp。这将大鼠中 -1174 bp 处出现的糖皮质激素反应元件(GRE) 替换为人类中 -1500 bp。大鼠中 -419 的近端 GRE 在人类中缺失。然而,在 DNA 插入片段内有一个类似 GRE 的微卫星区域,其中包含多个 GTT 重复序列以及额外的 GT(n) 序列。对每个外显子的内含子区域 5-prime 和 3-prime 进行测序。

通过将克隆的大鼠 TRPO cDNA 与中国仓鼠/人类杂交细胞 DNA 杂交进行作图,Comings 等人(1989) 将人类 TRPO 基因分配到染色体 4q25-q31。唐伦等人(1989) 使用相同的大鼠 cDNA 来鉴定同源的人类 cDNA,并使用后者通过原位杂交进行作图。他们得出结论,人类TRPO基因位于4q31-q32。通过原位杂交,Comings 等人(1991) 将 TRPO 基因定位于 4q31。

▼ 基因功能

奥皮兹等人(2011) 鉴定出色氨酸分解代谢物犬尿氨酸(kyn) 是人类芳烃受体(AHR; 600253) 的内源配体,由人类肿瘤细胞通过色氨酸 2,3-双加氧酶(TDO) 组成型产生。TDO 衍生的 kyn 通过 AHR 以自分泌/旁分泌方式抑制抗肿瘤免疫反应并促进肿瘤细胞存活和运动。TDO-AHR 通路在人类脑肿瘤中活跃,并与恶性进展和不良生存相关。奥皮兹等人(2011) 得出的结论是,由于 kyn 在癌症进展和局部微环境炎症过程中产生,其数量足以激活人类 AHR,因此他们的结果为先前未识别的 AHR 病理生理功能提供了证据,对癌症和免疫生物学具有深远的影响。

▼ 分子遗传学

通过分析从人肝脏 cDNA 文库中分离出的 TDO2 克隆,Comings 等人(1995) 在 TDO2 基因的外显子 7 中发现了 his-to-val 多态性。他们还鉴定了内含子 6 中由 G-to-T 和 G-to-A 2 bp 组成的多态性。内含子 5 的 3-prime 末端显示出广泛的 CCCCT 五核苷酸重复,具有明显的多态性。作者表示,这些多态性应该有助于检查 TDO2 在精神疾病中的可能作用。

高色氨酸血症

Ferreira 等人对一名患有先天性高色氨酸血症(HYPTRP; 600627) 的 28 岁女性进行了研究(2017) 鉴定了 TDO2 基因中 1 bp 重复(191070.0001) 和错义突变(M108I; 191070.0002) 的复合杂合性。对变体的分析表明,移码突变不产生可溶性蛋白质,而M108I突变酶的催化效率较低,并且容易发生蛋白水解降解。

▼ 动物模型

太等人(2016) 生成了缺乏 Tdo2、Ido1(147435) 或 Ido2(612129) 的小鼠,并在相隔 1 个月的 2 个时期内评估了它们的行为和认知功能。Ido1 -/- 小鼠在这两个时期都表现出早期昼间探索的减少。相比之下,Ido2 -/- 小鼠在这两个时期都表现出早期的昼间过度活跃。Tdo2 -/- 小鼠表现出白天和夜间活动增加,但仅在第二阶段。Ido2 -/- 小鼠在复杂的巡逻任务中似乎具有增强的参考记忆,而 Tdo2 -/- 小鼠在复杂的巡逻和辨别逆转任务中表现出增强的表现。神经化学测量显示,Ido1 -/- 小鼠的血清素水平降低,Tdo2 -/- 小鼠的色氨酸和血清素水平升高,而 Ido2 -/- 小鼠的神经化学水平没有变化。太等人(2016) 得出的结论是 Ido1、Ido2、

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):.

0001 高色氨酸血症(1 名患者)
TDO2、1-BP DUP、NT491
Ferreira 等人对一名患有先天性高色氨酸血症(HYPTRP; 600627) 的 28 岁女性进行了研究(2017) 鉴定了 TDO2 基因中 1 bp 重复(c.491dup) 的复合杂合性,导致预计会导致提前终止密码子(Ile165AspfsTer12) 和仅正常长度 43% 的蛋白质的移码,以及 c.324G-C 颠换,导致 met108 到 ile(M108I; 191070.0002)在高度保守的残基处进行取代。先证者未受影响的父母均具有其中一种突变的杂合子。据报道,121,218 条 ExAC 染色体中的 1 条存在重复,并且 ExAC 数据库中未发现 M108I 突变。移码变体不表达可溶性蛋白质。对 M108I 变体的分析表明,与野生型相比,催化效率降低,

.0002 高色氨酸血症(1 名患者)
TDO2,MET108ILE
讨论 TDO2 基因中的 c.324G-C 颠换,导致met108-to-ile(M108I) 取代,Ferreira 等人在一名高色氨酸血症患者(HYPTRP; 600627) 中发现复合杂合状态(2017),参见 191070.0001。