唾液酸结合免疫球蛋白样凝集素 11; SIGLEC11
HGNC 批准的基因符号:SIGLEC11
细胞遗传学位置:19q13.33 基因组坐标(GRCh38):19:49,948,824-49,961,171(来自 NCBI)
▼ 说明
SIGLEC 是细胞表面凝集素家族,由前 2 个免疫球蛋白(Ig) 样结构域中的共享结构基序以及它们通过第一个 Ig V 组结构域识别唾液酸的能力定义。
▼ 克隆与表达
Angata 等人通过在基因组数据库中搜索与 SIGLECs 同源的序列(2002) 确定了 SIGLEC11。 他们从胎儿肝脏 cDNA 文库中克隆了全长 cDNA。 推导的 686 个氨基酸蛋白包含 5 个胞外 Ig 样结构域、一个单次跨膜结构域和一个胞质尾部。 SIGLEC11 在其 N 末端具有保守的精氨酸和芳香族氨基酸,在第一和第二 Ig 样结构域中具有 3 个保守的半胱氨酸。 β 链 G 内所有其他 SIGLEC 中保守的芳香族氨基酸在 SIGLEC11 中被组氨酸取代。 RT-PCR 很容易在大脑、胎盘、肺、肝脏和胰腺中检测到 SIGLEC11,但在心脏、骨骼肌或肾脏中却检测不到。 外周血白细胞流式细胞术未发现SIGLEC11阳性细胞。 对人体组织切片的免疫组织化学分析揭示了肝脏库普弗细胞、肠固有层巨噬细胞、脑小胶质细胞、脾脏滤泡周细胞以及慢性炎症组织的强烈染色中的表达。 在小鼠巨噬细胞系中稳定表达的 SIGLEC11 在还原条件下可免疫沉淀为 100 kD 条带,在非还原条件下可免疫沉淀为 180 kD 条带,表明它以二硫键连接的二聚体形式存在于膜中。
▼ 基因功能
Angata 等人在 COS-7 细胞中使用瞬时转染(2002) 检测到 SIGLEC11 的细胞表面表达,但与其他 SIGLEC 不同,SIGLEC11 未能显示人红细胞的唾液酸依赖性结合。 他们使用几种唾液酸化寡糖进行酶联免疫吸附测定,发现 SIGLEC11 与 α-2-8 连接的唾液酸结合较弱,但具有严格的特异性,并且优先考虑较短的寡聚物。 最大结合明显弱于使用其他 SIGLEC 观察到的结果。 V set 结构域的 β 链 F 中保守精氨酸的点突变减少但并未消除结合。 当在酪氨酸磷酸酶抑制剂存在下从转染的小鼠巨噬细胞中纯化时,发现 SIGLEC11 被酪氨酸磷酸化,并且当磷酸化时,SIGLEC11 可以与 SHP1(176883) 和 SHP2(176876) 进行免疫共沉淀。
早川等人(2005) 分析了人类 SIGLEC11 和假基因 SIGLECP16 之间大约 3 kb 的同源性区域,并表明包含前 5 个外显子的大约 2 kb 的称为 A/A-prime 的片段具有 99.3% 的同一性。 然而,该区域的其余部分(指定为 B/B-prime)的同一性要低得多(94.6%)。 人类和黑猩猩基因组的 B/B-prime 系统发育树显示了基因同源性预期的拓扑结构。 相比之下,A/A 素数树显示了人类 SIGLEC11 和人类 SIGLECP16 的种内聚类,表明最近发生了基因转换事件。 成对遗传距离计算表明,虽然产生祖先 SIGLEC11 和 SIGLECP16 的假定基因复制事件早于人类-黑猩猩共同祖先,但随后的基因转换仅发生在人类谱系中。 人类SIGLEC11和人类SIGLECP16与黑猩猩SIGLECP16的关系比与黑猩猩SIGLEC11的关系更密切,并且人类SIGLEC11和黑猩猩SIGLECP16之间的遗传距离与SIGLECP16直向同源物之间的遗传距离几乎相同。 因此,人类 SIGLECP16 转换为人类 SIGLEC11。 对人类单核苷酸多态性(SNP) 数据库的搜索表明,SIGLEC11 序列对现代人类来说是通用的。 转换的区域包括 5-prime 上游区域和编码 Sia 识别域的外显子。 早川等人(2005) 研究了重组可溶性 Siglec11 蛋白的 Sia 结合特性。 黑猩猩 Siglec11 显示出比人类 SIGLEC11 更强大的结合,特别是与 N-乙醇酰神经氨酸(Neu5Gc)(人类中缺失的 Sia 类型)的结合。 人类 SIGLEC11 仍然结合寡唾液酸,而寡唾液酸在大脑中含量丰富。 8 个个体的人脑皮质小胶质细胞显示出强烈的 SIGLEC11 染色。 然而,尽管其他组织中的巨噬细胞染色呈阳性,但小胶质细胞仅在 5 只黑猩猩中偶尔染色,而在 2 只猩猩中则没有。 因此,早川等人(2005) 表明,大脑小胶质细胞在人类谱系中获得了特异且显着的 SIGLEC11 表达,这可能是由于 5-prime 上游区域的调控序列发生了变化。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Angata 等人(2002) 将 SIGLEC11 基因对应到染色体 19q13.3-q13.4,位于 SIGLEC3(159590) 相关基因簇上游约 1 Mb 处。 他们还在 SIGLEC11 基因上游约 8 kb 处鉴定了一个 SIGLEC11 假基因。