磷脂酰肌醇聚糖锚生物合成 G 类蛋白; PIGG
- GPI7,酿酒酵母,同源物;GPI7
HGNC 批准的基因符号:PIGG
细胞遗传学定位:4p16.3 基因组坐标(GRCh38):4:499,209-540,199(来自 NCBI)
▼ 描述
蛋白质膜锚定糖基磷脂酰肌醇(GPI) 在内质网(ER) 中通过逐步反应合成,并整体附着到新生蛋白质上。PIGG 是一种 ER 蛋白,参与磷酸乙醇胺(EtNP) 转移至主要 GPI 种类 H7 的第二个甘露糖(Man2),形成 GPI 种类 H8。H8 可以附着在蛋白质上,也可以作为游离 GPI 存在于细胞表面(Shishioh 等人,2005)。
▼ 克隆和表达
Shishioh 等人通过在数据库中搜索与酿酒酵母 Gpi7 相似的序列,然后进行胎盘 cDNA 文库的 5-rime RACE(2005)克隆了 PIGG,他们称之为 GPI7。推导的 983 个氨基酸的蛋白质具有 N 端信号序列、保守的 N 端腔磷酸二酯酶/核苷酸焦磷酸酶结构域和多个 C 端跨膜结构域。表达表位标记的 GPI7 的 CHO 细胞的蔗糖梯度分级显示,GPI7 与 ER 标记物分级。
▼ 基因功能
在 GPI 生物合成的后期,由 PIGO(614730) 和 PIGF(600153) 组成的酶复合物从 H6 生成带有与 Man3 连接的 EtNP 的 H7。Shishioh 等人利用 RNA 干扰(2005)发现GPI7的敲除导致HeLa细胞中H7的积累和H8的缺乏,这表明GPI7参与EtNP转移到H7上的Man2形成H8。转染的 CHO 细胞的共沉淀表明,人 PIGF 与 GPI7 和 PIGO 以孤立的复合物形式相互作用。与 PIGF 的相互作用稳定了 GPI7 和 PIGO,并且 GPI7 与 PIGO 竞争与 PIGF 的结合。GPI7 的过度表达降低了 PIGO 的含量并减少了 H7 的生成,这可能是由于可用 PIGF 的耗尽和 PIGO 的不稳定所致。Shishioh 等人(2005) 得出结论,PIGF 和 PIGO 相互作用,将 H6 转化为 H7,
▼ 基因结构
Shishioh 等人(2005)确定PIGG基因含有13个外显子。
▼ 测绘
Shishioh 等人的地图(2005) 指出 PIGG 基因对应到染色体 4p16.3。
▼ 分子遗传学
Makrythanasis 等人在来自 2 个不相关的近亲家庭的 4 名常染色体隐性遗传性智力发育障碍 53(MRT53; 616917) 患者中进行了研究(2016) 在 PIGG 基因中发现了 2 个不同的纯合突变(616918.0001 和 616918.0003)。来自第三个家庭的一名患者是复合杂合子,存在错义突变(616918.0002) 和包含 PIGG 基因的大缺失。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。对来自两个家族的患者细胞的研究表明,PIGG 功能丧失,但 GPI 锚定蛋白表达正常。
▼ 等位基因变异体(3 个选定示例):.
0001 智力发育障碍,常染色体隐性遗传 53
PIGG,GLN310TER
Makrythanasis 等人在 2 名同胞中,由近亲埃及父母(EG 家族)所生,患有常染色体隐性遗传性智力发育障碍 53(MRT53;616917)(2016) 鉴定了 PIGG 基因中的纯合 c.928C-T 转换(c.928C-T, NM_001127178.2),导致 gln310 到 ter(Q310X) 的替换。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离,并且在 dbSNP(build 138)或 ExAC 数据库或内部数据库中未发现。患者细胞表现出 H7 和 H7' GPI 前体的异常积累,并且缺乏 H8,这与 PIGG 功能的丧失一致。这些缺陷在用野生型PIGG转染后得到恢复。然而,患者细胞显示出正常的 GPI 锚定蛋白,表明 PIGG 的丢失不会影响这些蛋白质的细胞表面水平;总体GPI结构也正常。
.0002 智力发育障碍,常染色体隐性遗传 53
PIGG,ARG669CYS(rs372392424)
Makrythanasis 等人在一名患有常染色体隐性遗传性智力发育障碍 53(MRT53;616917)的日本女孩中进行了研究(2016) 在 PIGG 基因中发现了一个杂合的 c.2005C-T 转换(rs372392424),导致 arg669 到 cys(R669C) 取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,存在于未受影响的父亲身上。根据 ExAC Browser,该基因在 575 个内部对照外显子组中的 4 个中被发现,并且在东亚人群中出现频率较低(0.06%)。母体染色体携带 2.4 Mb 的从头微缺失,其中包括 PIGG 基因。患者细胞表现出 H7 和 H7' GPI 前体的异常积累,并且缺乏 H8,这与 PIGG 功能的丧失一致。这些缺陷在用野生型PIGG转染后得到恢复。然而,患者细胞显示出正常的 GPI 锚定蛋白,表明 PIGG 的缺失不会影响这些蛋白的细胞表面水平;总体GPI结构也正常。
.0003 智力发育障碍,常染色体隐性遗传 53
PIGG,c.2261+1G-C
2 个兄弟,由巴基斯坦近亲出生,患有常染色体隐性遗传智力发育障碍 - 53(MRT53;616917),Makrythanasis 等人(2016) 鉴定了 PIGG 基因(c.2261+1G-C, NM_001127178.2) 中的纯合 G 到 C 颠换,预计会影响剪接位点。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离,并且在 dbSNP(版本 138)、1000 基因组计划、外显子组变异服务器或 ExAC 数据库或包含 2,500 个外显子组的内部数据库中未发现。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。