异构核糖核蛋白H1

异质核核糖核蛋白(hnRNPs)构成了一组与异质核RNA(hnRNA)结合的多肽,异质核RNA是由RNA聚合酶II产生的转录物(参见180660)。已经描述了超过20种这样的蛋白质,并用字母A到U进行了命名。通过分子cDNA克隆,二维凝胶免疫印迹和氨基酸微测序,Honor 等人(1995年)确定了3个序列独特和独特的蛋白质,构成了普遍表达的hnRNPs亚科。hnRNP H和H-prime(HNRNPH2; 300610)之间的同一性是96%,H和F(HNRNPF; 601037)之间是78%,H-prime和F之间是75%。

细胞遗传学位置:5q35.3
基因座标(GRCh38):5:179,614,177-179,634,783

▼ 基因功能
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增田等(2008年)确定了CHRNA1基因(100690)内含子中的关键核苷酸,该核苷酸是hnRNP H靶向的内含子剪接沉默子(ISS)序列的一部分,并抑制了CHRNA1基因中包含一个替代性外显子。对人类基因组的分析表明,hnRNP H结合基序“ UGGG”在内含子的3个主要末端附近被过度表达。增田等(2008)发现其他几个基因的替代外显子,包括GRIP1(604597),FAS(TNFRSF6; 134637),VPS13C(608879)和NRCAM(601581))被hnRNP H下调。这些发现表明,下游内显子的剪接调节子是内含子3-prime末端附近的hnRNP H结合基序的存在。

Van Dusen等(2010)指出,人类HNRNPH1和HNRNPF具有3个RNA结合结构域和2个富含甘氨酸的结构域,并且定位于细胞核和细胞质。他们使用缺失突变体发现中央GYR(gly-tyr-arg)结构域是核定位所必需的。他们在GYR域中发现了一个非经典的核定位信号,该信号与转移蛋白1(TNPO1; 602901)相互作用,后者介导了核的输入。Van Dusen等(2010年)得出的结论是HNRNPH1和HNRNPF是转录和GYR域依赖的穿梭蛋白。

Grammatikakis等(2016)指出,在啮齿类动物中,选择性剪接会产生一个短的Trf2(TERF2; 602027)变体Trf2s,其仅包含外显子7的一部分,并参与神经元基因的抑制。使用大鼠小脑提取物的蛋白质组学筛选,Grammatikakis等人(2016)发现RNA结合蛋白Hnrnph1和Hnrnph2与Trf2 pre-mRNA的外显子7相互作用。HNRNPH蛋白抑制了外显子7中5个主要替代剪接位点的使用,促进了外显子7的包含,从而增加了全长Trf2的相对水平并降低Trf2s的丰度。HNRNPH蛋白水平在神经元分化过程中降低,而Trf2s水平升高。CRISPR介导的Hnrnph2缺失可促进神经元分化。Grammatikakis等(2016)得出结论,HNRNPH1和HNRNPH2至少部分地通过抑制TRF2的可变剪接来抑制神经元分化。

▼ 测绘
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通过荧光原位杂交,Honore等人(1995)将HNRNPH1基因定位到5q35.3染色体上。