tRNA 剪接核酸内切酶，亚基 2; TSEN2

tRNA 剪接核酸内切酶 2，酿酒酵母，同源物
SEN2，酵母，同源物；SEN2

HGNC 批准的基因符号：TSEN2

细胞遗传学定位：3p25.2 基因组坐标（GRCh38）：3:12,484,455-12,539,623（来自 NCBI）

▼ 描述

TSEN2 基因编码异四聚体 tRNA 剪接核酸内切酶复合物的催化亚基，该复合物参与 tRNA 分子的成熟。另一个催化亚基由 TSEN34（608754）编码，2 个结构亚基由 TSEN54（608755）和 TSEN15（608756）编码（Bierhals 等人总结，2013）。

tRNA 剪接是细胞生长和分裂所需的基本过程。SEN2 是 tRNA 剪接核酸内切酶的一个亚基，它催化内含子的去除，这是 tRNA 剪接的第一步（Paushkin 等，2004）。

▼ 克隆和表达

Paushkin等人通过使用酵母Sen2作为探针搜索序列数据库，然后对人类cDNA文库进行PCR（2004）分离出全长 SEN2 cDNA 和缺乏外显子 8 的剪接变体。全长 SEN2 含有 465 个氨基酸，计算分子量为 51 kD。它仅在活性位点域与酵母 Sen2 具有高度相似性。缺少第 8 号外显子的 SEN2 变体包含 448 个氨基酸。Northern 印迹分析检测到所有检查组织中两种 SEN2 转录物的低表达。转染的 HeLa 细胞的免疫荧光显微镜将两种 SEN2 亚型定位于细胞核。缺乏外显子 8 的变异体常见于核仁中的点状结构中。

▼ 基因功能

Paushkin 等人（2004）鉴定并表征了人类 tRNA 剪接核酸内切酶。该酶由 SEN2、SEN34（608754）、SEN15（608756）和 SEN54（608755）组成，它们是酵母 tRNA 核酸内切酶亚基的同源物。此外，缺少外显子 8 的 SEN2 变体是具有独特 RNA 核酸内切酶活性的复合物的一部分。保什金等人（2004）发现两种人核酸内切酶复合物都与前 mRNA 3-引物末端加工因子相关，包括 CLP1（608757）。小干扰 RNA 介导的 SEN2 缺失导致前 tRNA 和前 mRNA 的成熟缺陷。这些发现证明了 tRNA 前体剪接和 mRNA 前体 3 引物末端形成之间的联系，表明核酸内切酶亚基在多个 RNA 加工事件中发挥作用。

▼ 测绘

国际辐射混合定位联盟将 TSEN2 基因定位到 3 号染色体（RH103927）。

▼ 分子遗传学

在一名患有 2 型脑桥小脑发育不全的巴基斯坦近亲血统患者（PCH2B; 612389）中，Budde 等人（2008）鉴定了 TSEN2 基因中的纯合错义突变（Y309C; 608753.0001）。

Namavar 等人在 2 名患有 PCH2B 的同胞中（2011）鉴定了 TSEN2 基因中的复合杂合突变（608753.0001 和 608753.0002）。没有进行变体的功能研究。

Bierhals 等人在一名患有 PCH2B 的德国男婴中进行了研究（2013）鉴定了 TSEN2 基因中的复合杂合突变（608753.0003 和 608753.0004）。

▼ 等位基因变异体（4个选定的例子）：

.0001 桥脑小脑发育不全，2B型
TSEN2，TYR309CYS
在巴基斯坦男性中，近亲结婚的产物，患有2型脑桥小脑发育不全（PCH2B；612389），其中未发现TSEN54（608755）突变，巴德等人（2008）鉴定了 TSEN2 基因中的纯合 926A-G 转变，导致 tyr309 到 cys（Y309C）取代。在 188 名健康的巴基斯坦对照者、92 名荷兰人、45 名中国人或 28 名巴勒斯坦对照者中未发现该变异。309 位的酪氨酸在真核生物中是严格保守的（酪氨酸或苯丙氨酸）。

Namavar 等人在 2 名患有 PCH2B 的同胞中（612389）（2011）鉴定了 TSEN2 基因中的复合杂合突变：Y309C 突变和内含子 7（c.960+1delGTAAG）中的 5 bp 缺失（608753.0002），预计会导致外显子 7 的跳跃。未对这些变体进行功能研究。

.0002 脑桥小脑发育不全，2B 型
TSEN2，5-BP DEL
用于讨论 Namavar 等人在 2B 型脑桥小脑发育不全患者（PCH2B; 612389）患者中以复合杂合状态发现的 TSEN2 基因（c.960+1delGTAAG）内含子 7 中的 5-bp 缺失（2011），参见 608753.0001。

.0003 脑桥小脑发育不全，2B 型
TSEN2，GLY312ARG
Bierhals 等人对一名患有 2B 型脑桥小脑发育不全（PCH2B; 612389）的 4 岁德国男孩进行了研究（2013）鉴定了 TSEN2 基因中的复合杂合突变：外显子 7 中的 c.934G-A 转变，导致高度保守残基处的 gly312 至 arg（G312R）取代，以及外显子 5 中的 c.691C-T 转变，导致 gln231 至 ter（Q231X; 608753.0004）取代。每个未受影响的亲本都是其中一种突变的杂合子；分别在 200 和 180 条对照染色体中未发现突变。对患者白细胞的分析表明，C 到 T 的突变改变了蛋白质的各种转录本，并不总是导致无义介导的 mRNA 衰减，但没有对这些变体进行额外的功能研究。

.0004 脑桥小脑发育不全，2B 型
TSEN2，GLN231TER
用于讨论 Bierhals 等人在 2B 型脑桥小脑发育不全（PCH2B；612389）患者中以复合杂合状态发现的 TSEN2 基因中的 gln231-to-ter（Q231X）突变（2013），参见 608753.0003。