肝癌衍生生长因子样蛋白 2; HDGFL2
- HDGF 样蛋白 2
- HDGF相关蛋白2; 辣根过氧化物酶2; 高密度GFRP2
HGNC 批准的基因符号:HDGFL2
细胞遗传学定位:19p13.3 基因组坐标(GRCh38):19:4,472,296-4,502,219(来自 NCBI)
▼ 说明
HDGFL2 与转录沉默基因相关的组蛋白结合,并招募参与 DNA 损伤位点同源重组修复的因子(Baude et al., 2016)。
▼ 克隆与表达
泉本等人(1997) 克隆了小鼠 Hdgfl2,他们将其称为 Hrp2。 推导的 669 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 74.3 kD。 Hrp2 具有大量带电残基,并且富含脯氨酸和丝氨酸。 Hrp2 还与 HDGF(600339) 和小鼠 Hrp1(Hdgfl1) 共享大约 98 个残基的 N 端结构域。 对 8 个小鼠组织进行 Northern 印迹分析,检测到主要 2.5 kb Hrp2 转录物在睾丸中表达最高,而在除脾脏之外的所有其他组织中表达较低,脾脏几乎没有 Hrp2 表达。 Hrp2 还在除脾脏之外的所有组织中表达为较小的 3.5-kb 转录物。
鲍德等人(2016) 表明,670 个氨基酸的人类 HDGFL2 蛋白(他们称之为 HDGFRP2)具有 N 端 PWWP 结构域、中央 AT 钩状基序和 C 端整合酶结合结构域。 免疫组织化学分析在间期 U2OS 和 HeLa 细胞中检测到呈点状核模式的 HDGFRP2。 HDGFRP2 部分从有丝分裂细胞的浓缩染色体上解离。
▼ 基因功能
吴等人(2011) 发现分离的人 HDGF2 PWWP 结构域与甲基化组蛋白的结合较弱。
Baude 等人使用短干扰 RNA(2016) 发现人类 U2OS 和 HeLa 细胞中 HDGFRP2 的缺失会导致自发性 DNA 损伤并导致细胞死亡。 HDGFRP2 的敲低会损害 DNA 损伤诱导的 RPA2(179836) 磷酸化以及 RBBP8(604124) 募集至 DNA 双链断裂。 HDGFRP2 在体外优先结合转录沉默染色质特征的组蛋白标记,并用 CBX1(604511) 和 POGZ(614787) 进行免疫沉淀。 鲍德等人(2016) 得出结论,HDGFRP2 可能与 POGZ 复合,招募参与同源重组的因子到受损的沉默基因或 DNA 损伤时沉默的活性基因。
▼ 测绘
Hartz(2018) 根据 HDGFL2 序列(GenBank BC000755) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 HDGFL2 基因对应到染色体 19p13.3。