异向性和多向性逆转录病毒受体; XPR1
- X 受体
- SYG1,酵母,同源物;SYG1
HGNC 批准的基因符号:XPR1
细胞遗传学位置:1q25.3 基因组坐标(GRCh38):1:180,632,021-180,890,278(来自 NCBI)
▼ 描述
XPR1 基因编码异向性和多向性鼠病毒的受体(Tailor 等人,1999)。鼠白血病病毒(MLV) 有 4 类:异嗜性(X)、亲嗜性(E)、兼嗜性(A) 和多嗜性(P)。X-和E-MLV不能外源感染小鼠细胞,并且作为小鼠基因组的一部分遗传。虽然 X-MLV 可以感染其他哺乳动物物种,但不能感染实验室小鼠的细胞,但 A-(参见 SLC20A2;158378)和 P-MLV 可以感染小鼠和其他物种。请参阅 Levy(1999) 对 MLV 的回顾。
▼ 克隆与表达
Tailor 等人通过将人 T 淋巴细胞 cDNA 文库克隆到逆转录病毒载体中,将该文库转导到天然 X-MLV 抗性小鼠成纤维细胞中,并进行 PCR 扩增(1999) 分离出编码 XPR1 的 cDNA。XPR1 在小鼠和仓鼠 MLV 抗性成纤维细胞中的表达使细胞对 X- 和 P-MLV 敏感。推导的 696 个氨基酸的 XPR1 蛋白包含 8 或 9 个潜在的跨膜区域、7 个潜在的 N-糖基化位点和 7 个可能通过网格蛋白包被的凹坑刺激内吞作用的双亮氨酸。Northern印迹分析在所有测试的组织中检测到4.5-kb XPR1转录物,其中在胰腺、肾、胎盘、造血组织和心脏中表达最高,在骨骼肌中表达最低。XPR1 在胎儿肝脏中的表达高于成人肝脏。9.
使用类似于 Tailor 等人的方法(1999),巴蒂尼等人(1999) 分离出编码 XPR1 的 cDNA。序列分析预测,XPR1 与酵母 Syg1 蛋白具有 25% 的氨基酸同一性,在 8 个疏水结构域之前包含一个 236 个氨基酸的亲水 N 端区域。
▼
通过辐射混合分析进行绘图,Battini 等人(1999) 将 XPR1 基因对应到 1q25.1,两侧是 AT3(107300) 和 LAMC1(150290) 基因。杨等人(1999) 和 Tailor 等人(1999) 将小鼠 Xpr1 基因(也称为 Rmc1)定位到 1 号染色体。
▼ 基因功能
XPR1 蛋白介导磷酸盐输出,表明它在磷酸盐稳态中发挥作用(Legati 等人的总结,2015)。
▼ 分子遗传学
瑞典血统的一个大家族的 9 名受影响成员患有特发性基底神经节钙化-6(IBGC6;616413),最初由 Boller 等人报道(1977),莱加蒂等人(2015) 鉴定出 XPR1 基因中的杂合错义突变(L145P; 605237.0001)。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。对 86 名患有类似疾病的患者进行 XPR1 进一步测序,发现来自 4 个无关家族的 5 名患者存在杂合致病性错义突变(605237.0002-605237.0004)。体外功能表达研究表明,所有突变都会不同程度地损害磷酸盐流出。莱加蒂等人。
▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):.
0001 基底神经节钙化、特发性、6
XPR1、LEU145PRO
在瑞典血统的一个大家族的受影响成员中,患有特发性基底神经节钙化-6(IBGC6;616413),最初由 Boller 等人报道(1977),莱加蒂等人(2015) 在 XPR1 基因中发现了一个杂合的 c.434T-C 转换(c.434T-C, NM_004736.3),导致 SPX 结构域中高度保守的残基处由 leu145 变为 pro(L145P)。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与该家族中的疾病分离,并且在 dbSNP(版本 138)、1000 基因组计划、外显子组变异服务器或外显子组聚合联盟数据库或 287 个内部对照外显子组中未发现。对 86 例患有类似疾病的 XPR1 进行进一步测序,发现来自法国家庭的 2 名受影响个体中存在相同的 L145P 变异。与对照组相比,患者细胞的磷酸盐流出受损,体外功能表达研究表明,在 XPR1 缺失细胞感染期间,突变蛋白无法重建磷酸盐流出或充当 X-MLV 的受体。流式细胞术表明,尽管突变蛋白的表达水平正常,但突变影响了 XPR1 的细胞表面暴露,导致突变蛋白保留在细胞中。该突变还表现出显性失活效应,干扰内源性 XPR1 的磷酸盐流出。流式细胞术表明,尽管突变蛋白的表达水平正常,但突变影响了 XPR1 的细胞表面暴露,导致突变蛋白保留在细胞中。该突变还表现出显性失活效应,干扰内源性 XPR1 的磷酸盐流出。流式细胞术表明,尽管突变蛋白的表达水平正常,但突变影响了 XPR1 的细胞表面暴露,导致突变蛋白保留在细胞中。该突变还表现出显性失活效应,干扰内源性 XPR1 的磷酸盐流出。
.0002 基底神经节钙化,特发性,6
XPR1,SER136ASN
在患有特发性基底神经节钙化 6(IBGC6;616413) 的男性中,Legati 等人(2015) 在 XPR1 基因中鉴定出一个杂合的 c.407G-A 转换(c.407G-A, NM_004736.3),导致 SPX 结构域中的保守残基处出现 ser136 到 asn(S136N) 的取代。在 dbSNP(版本 138)、1000 基因组计划、外显子组变异服务器或外显子组聚合联盟数据库或 287 个内部对照外显子组中未发现该突变。体外研究表明,突变蛋白存在于质膜上并充当逆转录病毒受体,但磷酸盐流出受到损害。
.0003 基底神经节钙化,特发性,6
XPR1,LEU140PRO
在患有特发性基底神经节钙化 6(IBGC6;616413) 的男性中,Legati 等人(2015) 在 XPR1 基因中鉴定出杂合的 c.419T-C 转换(c.419T-C, NM_004736.3),导致 SPX 结构域中的保守残基处由 leu140 变为 pro(L140P)。在 dbSNP(版本 138)、1000 基因组计划、外显子组变异服务器或外显子组聚合联盟数据库或 287 个内部对照外显子组中未发现该突变。体外研究表明,突变蛋白存在于质膜上并充当逆转录病毒受体,但磷酸盐流出受到损害。
.0004 基底神经节钙化,特发性,6
XPR1,LEU218SER
在患有特发性基底神经节钙化-6(IBGC6;616413)的女性中,Legati 等人(2015) 在 XPR1 基因中发现了一个杂合的 c.653T-C 转换(c.653T-C, NM_004736.3),导致 SPX 结构域附近的保守残基处发生 leu218 到 Ser(L218S) 的取代。据报道,患者已故母亲受到影响,但无法获得 DNA。在 dbSNP(版本 138)、1000 基因组计划、外显子组变异服务器或外显子组聚合联盟数据库或 287 个内部对照外显子组中未发现该突变。体外研究表明,突变蛋白存在于质膜上并充当逆转录病毒受体,但磷酸盐流出受到损害。