NPTN INTRONIC 转录 1，非编码; NPTNIT1

• 长非编码RNA，在肿瘤中低表达
• lncRNA LET

HGNC 批准的基因符号：NPTN-IT1

细胞遗传学位置：15q24.1 基因组坐标（GRCh38）：15:73,566,937-73,569,542（来自 NCBI）

▼ 说明

NPTNIT1 是一种长非编码 RNA，可通过泛素-蛋白酶体途径促进双链 RNA 结合蛋白 NF90（ILF3; 603182） 的降解（Yang et al., 2013）。

▼ 克隆与表达

杨等人（2013） 发现了 NPTNIT1，他们将其称为 lncRNA-LET，因为与正常组织相比，NPTNIT1 在多种癌症中表达下调。 LncRNA-LET 包含 1,947 个核苷酸。

▼ 基因功能

杨等人（2013） 发现，与所检查的配对瘤周样本相比，lncRNA-LET 在大多数肝细胞癌、结直肠癌和鳞状细胞肺癌中显着表达不足。 lncRNA-LET的表达或敲低分别降低或升高肝癌细胞系和结肠癌细胞系体外迁移和裸鼠体内转移的能力。 RNA Pull-down、质谱、电泳迁移率变化和蛋白质印迹分析表明，lncRNA-LET 的 3 引物末端以 1:1 的化学计量比直接与 NF90 相互作用。 过表达和敲低研究表明，lncRNA-LET 通过 NF90 泛素化和蛋白酶体介导的降解下调 NF90 蛋白含量。 缺氧条件通过 HDAC3（605166） 介导的 lncRNA-LET 启动子处的组蛋白脱乙酰作用降低了 lncRNA-LET 含量，从而增加了 NF90 的蛋白质含量，并导致 HIF1-α（HIF1A; 603348） mRNA 的稳定，并促进缺氧条件下的细胞生长。 lncRNA-LET-NF90 关联还间接调节 CDC42 的蛋白质含量（116952）。

▼ 测绘

Hartz（2013） 根据 NPNIT1 序列（GenBank AK055007） 与基因组序列（GRCh37） 的比对，将 NPTNIT1 基因对应到染色体 15q24.1。