成红细胞膜相关蛋白; ERMAP

  • ERYTHROID MEMBRANE-ASSOCIATED PROTEIN
  • ERYTHROCYTE MEMBRANE-ASSOCIATED PROTEIN

HGNC 批准的基因符号:ERMAP

细胞遗传学定位:1p34.2 基因组坐标(GRCh38):1:42,817,121-42,844,990(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Xu等人通过对妊娠早期和晚期胎儿肝脏进行消减杂交,然后进行5-prime RACE(2001) 克隆 ERMAP。推导的 475 个氨基酸蛋白包含 N 端胞外 IgV 结构域、跨膜结构域和 C 端胞质 B30.2 结构域。细胞质区域还具有多个假定的磷酸化位点和许多后高尔基体分选信号。ERMAP 不包含小鼠 Ermap 中的 IgC 结构域。Northern 印迹分析检测到在胎儿肝脏、脐带血和成人骨髓中表达的 3.5 kb 转录物,但在红细胞耗尽的骨髓或外周血细胞中不表达。FISH 检测胎儿和成人成红细胞和网织红细胞中的 ERMAP。使用针对 IgV 结构域的抗体进行免疫荧光定位,检测细胞表面的 ERMAP。

Su等人通过筛选胎儿肝脏cDNA文库,然后对红白血病细胞系、胎儿肝脏和骨髓进行5-prime RACE(2001) 克隆 ERMAP。Northern印迹分析检测到胎儿肝脏和成人骨髓中的强表达。在其他造血组织和细胞中检测到弱表达,但在其他组织中未检测到。在结直肠腺癌细胞系和肺癌细胞系中也检测到表达,但在其他肿瘤细胞系中未检测到表达。荧光标记的 ERMAP 在转染胚胎肾细胞的质膜和离散细胞质体中表达。

▼ 基因结构

Su et al.(2001) 确定 ERMAP 基因包含 11 个外显子,跨度约为 19 kb。

通过基因组序列分析,Su 等人(2001) 将 ERMAP 基因定位到染色体 1p34。他们将小鼠 Ermap 基因定位到 4 号染色体的一个区域,该区域显示出与人类染色体 1p36-p32 同线性的同源性。Velliquette(2005) 将 ERMAP 基因置于 1p34.2。

▼ 分子遗传学

Scianna血型系统(111750)最初由2种对立抗原代表,即高频抗原Sc1和低频抗原Sc2。抗原 Sc3 在所有红细胞上表达,但非常罕见的 Sc:-1,-2 表型除外,其中 3 簇在受限群体中观察到(Issitt 和 Anstee,1998)。斯普林等人(1990) 表明 Sc 抗原驻留在 Scianna 糖蛋白上。

Scianna 抗原被证明与 Rh 抗原具有遗传关联,Rh 抗原对应到染色体 1p36-p34,但被发现是不同的。Spring(1993) 证明,第二种低频抗原 Radin(RD; 111620) 对应到 1 号染色体上的相同位置,并驻留在类似大小的蛋白质上。抗 Sc2 和抗 Rd 均具有临床相关性,可引起新生儿溶血病。因为 ERMAP 基因与 Scianna、Wagner 等人共享基因组位置、蛋白质产物大小以及红细胞膜表面定位(2003) 对具有已知 Scianna 和 Rd 表型的先证者的 ERMAP 基因进行了测序。Wagner 等人在沙特阿拉伯谱系中的 Sc:-1,-2 先证者中(2003) 仅发现一个 ERMAP 等位基因在外显子 3 中存在 2-bp 缺失,导致移码(609017.0001)。一个Sc:-1,2 先证者是 ERMAP 等位基因的纯合子,具有 gly57 至 arg 取代(609017.0002)。Rd+先证者的 ERMAP 等位基因是 pro60 至 ala 取代的杂合子(609017.0003)。瓦格纳等人(2003) 开发了具有序列特异性引发的聚合酶链式反应(PCR-SSP) 系统来检测 ERMAP 基因的 Sc2 和 Rd 等位基因。这 2 个等位基因在人群中的出现频率约为 1% 或低于 1%,这与白人中已知的 Sc2 和 Rd 抗原的频率相一致。

Velliquette(2005) 对 Scianna 血型系统进行了全面回顾,并列出了 Scianna 多态性和 SC(null) 表型背后的 ERMAP 基因中的各种核苷酸取代。

▼ 等位基因变体(4 个选定示例):

.0001 SCANNA 血型系统,SC:-1,-2
ERMAP, 2-BP DEL
在来自沙特阿拉伯的 SC:-1,-2(111750) 谱系中,Wagner 等人(2003)发现先证者的ERMAP基因外显子3有2-bp缺失,导致移码。该缺失可能是由于 GAGAGA 重复序列中 DNA 聚合酶的滑动错误造成的。移码产生了 113 个氨基酸的截短蛋白质。

.0002 SCANNA 血型系统,SC:-1,2
ERMAP,GLY57ARG
Wagner 等人(2003) 对 Sc:-1,2(111750) 先证者的 ERMAP 基因的 11 个外显子进行了测序,并证明了 169G-A 转换(相对于起始密码子的 A)的纯合性,导致 gly57 到 arg(G57R) 的取代。通过对另外 2 个不相关的 Sc:-1,2 先证者的 ERMAP 外显子 3 进行核苷酸测序,证明了 G57R 等位基因的纯合存在。两个 Sc:1,2 样本的 G57R 等位基因是杂合的。来自德国献血者的 305 个样本中有 5 个携带杂合形式的 G57R 等位基因。ERMAP G57R 等位基因的单倍型频率为 0.008。

.0003 RADIN 血型抗原
ERMAP,PRO60ALA
Wagner 等人(2003) 对 Rd+(111620) 先证者的 ERMAP 基因进行了测序,发现 178C-G 颠换的杂合性导致了 pro60 到 ala(P60A) 的取代。在 305 名德国献血者中,没有人 P60A 等位基因呈阳性。然而,在另一组随机捐赠者中,发现了 ERMAP P60A 阳性样本。

.0004 SCANNA 血型系统、星抗原
ERMAP、GLU47LYS
Hue-Roye 等人(2005) 证明 Scianna 血型系统(111750) 中高流行的 Star 抗原是由 ERMAP 基因外显子 3 中的 139G-A 替换引起的,导致 glu47 到 lys 替换。