H2A.B 变体组蛋白 3; H2AB3

H2A 组蛋白家族，成员 B3；H2AFB3
H2A 组蛋白家族，成员 B；H2AFB
H2A 组蛋白，巴尔体缺陷；H2ABBD; H2A.BBD

HGNC 批准的基因符号：H2AB3

细胞遗传学位置：Xq28 基因组坐标（GRCh38）：X:155,459,414-155,460,004（来自 NCBI）

▼ 说明

组蛋白包裹 DNA 形成核小体颗粒，从而压缩真核基因组。每个核小体核心颗粒均由八聚体包裹的 DNA 组成，八聚体含有 2 个高度保守的组蛋白 H2A（见 613499）、H2B（见 609904）、H3（见 602810）和 H4（见 602822）分子。H1 组蛋白（参见 142709）占据核小体之间的连接 DNA。典型组蛋白基因聚集在重复序列中，它们的转录与 DNA 复制紧密结合。相比之下，非经典变体组蛋白基因在基因组中单独发现，组成型表达，并编码初级氨基酸序列与其经典旁系同源物不同的组蛋白。与主要在基因组包装和基因调控中发挥作用的规范组蛋白不同，变异组蛋白在 DNA 修复、减数分裂重组、染色体分离、转录起始和终止、性染色体浓缩和精子染色质包装。H2AB3 是 H2A 家族的变体组蛋白（Talbert 和 Henikoff 评论，2010）。

有关组蛋白、组蛋白基因簇和 H2A 组蛋白家族的更多背景信息，请参见 HIST1H2AA（613499）。

▼ 克隆与表达

通过使用 H2A 组蛋白家族成员的序列搜索数据库（参见 142711），Chadwick 和 Willard（2001）鉴定了编码 H2AFB 的 EST，他们将其命名为 H2ABBD。推导的 115 个氨基酸的 H2AFB 蛋白的计算分子量约为 13 kD。它与组蛋白折叠的 α 螺旋内的其他 H2A 组蛋白具有最高的序列同一性，并且包含高度碱性的 N 和 C 末端。H2AFB 在 H2A 组蛋白中是独一无二的，因为该蛋白不具有在其他 H2A 组蛋白中翻译后修饰的保守残基，并且 cDNA 包含聚腺苷酸化序列和聚（A）尾。Northern 印迹分析检测到仅在睾丸中表达的 0.9-kb 转录物。RT-PCR 检测了多种组织和细胞系中的表达。在 46,XY 成纤维细胞中，荧光标记的 H2AFB 定位于细胞核。在雌性细胞中，它被排除在巴尔体之外。双标记实验显示 H2AFB 和乙酰化组蛋白 H4 在间期细胞核和中期染色体上共定位。染色质分级分离证明了 H2AFB 与组蛋白的关联，核酸酶消化的染色质的蔗糖梯度超速离心显示了 H2AFB 与核小体的共分级分离。Chadwick 和 Willard（2001）得出结论，H2AFB 在核小体中富集，并且与转录活性区域相关。核酸酶消化的染色质的蔗糖梯度超速离心显示 H2AFB 与核小体的共分离。Chadwick 和 Willard（2001）得出结论，H2AFB 在核小体中富集，并且与转录活性区域相关。核酸酶消化的染色质的蔗糖梯度超速离心显示 H2AFB 与核小体的共分离。Chadwick 和 Willard（2001）得出结论，H2AFB 在核小体中富集，并且与转录活性区域相关。

Bonisch 和 Hake（2012）在他们的评论中指出，H2A.BBD 与 H2A 大约有 50% 相同。它比 H2A 短得多，因为它缺少 C 末端尾部和部分对接域。此外，H2A.BBD几乎不含酸性斑块和较少的赖氨酸残基，并且H2A.BBD中酸性斑块的改变影响染色质的高阶结构。H2A.BBD 并非存在于所有组织中，但它在睾丸中表达强烈，在大脑中表达水平较低。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Chadwick 和 Willard（2001）将 H2AFB 基因定位到染色体 Xq28。

Gross（2019）根据 H2AB3 序列（GenBank NM_080720）与基因组序列（GRCh38）的比对，将 H2AB3 基因对应到染色体 Xq28。H2AB 基因的另外两个拷贝 H2AB1（301037）和 H2AB2（301038）位于染色体 Xq28 上。H2AB3 是最端粒的拷贝，H2AB1 是最着丝粒的拷贝。

▼ 基因功能

Talbert 和 Henikoff（2010）在他们的综述中指出，H2ABBD 与活性染色质相关，并且含有 H2ABBD 的核小体在没有 DNA 的情况下不稳定。

Bao 等人使用纯化的重组小鼠蛋白（2004）证明 H2a.Bbd 与 H2b、H3 和 H4 有效组装成规则间隔的核小体阵列，并在体外通过 RNA 聚合酶 II 抑制转录。转录激活剂和共激活剂的作用可以减轻抑制。

Tolstorukov 等人使用 HeLa 细胞中的表达分析（2012）证实 H2A.BBD 在体内组装成核小体，其 DNA 比 H2A 核小体更短。染色质免疫沉淀测序分析表明，H2A.BBD 与活性染色质相关，并且在参与广泛细胞功能（包括 RNA 聚合酶 II）的表达基因体中富集。H2A.BBD 染色质与对剪接体的组装和功能很重要的蛋白质相关，并且 H2A.BBD 参与 mRNA 加工和选择性剪接，外显子包含净减少。

Bonisch 和 Hake（2012）在他们的综述中指出，睾丸特异性 H2a.Bbd 与活跃转录的染色质相关，并参与小鼠精子发生，可能是通过组蛋白到鱼精蛋白的替代发挥作用。

▼ 生化特征

Bao 等人利用体外重构实验（2004）表明，与 H2A 不同，人类 H2A.BBD 不会与小鼠 H2b、H3 和 H4 一起重折叠成稳定的组蛋白八聚体。相反，H2A.BBD 形成了结构改变的核小体核心颗粒（NCP），其具有相同化学计量的 4 种组蛋白和 DNA。在 H2A.BBD NCP 中，DNA 末端受到的约束较少，并且部分从组蛋白八聚体表面解离，导致与 H2A NCP 相比，结构不太紧凑、松弛。在 H2A.BBD NCP 中，146 bp DNA 中只有约 118 bp 受到保护，免受微球菌核酸酶消化。结构域交换实验表明，H2A 和 H2A.BBD 对接结构域之间的氨基酸差异是造成 H2A.BBD NCP 构象改变的原因。