OBSCURIN; OBSCN

  • KIAA1556
  • KIAA1639

此条目中代表的其他实体:

  • OBSCURIN-RHOGEF
  • OBSCURIN-MLCK

HGNC 批准的基因符号:OBSCN

细胞遗传学位置:1q42.13 基因组坐标(GRCh38):1:228,208,043-228,378,875(来自 NCBI)

文本

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从尺寸分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2000) 克隆了部分 OBSCN cDNA,他们将其命名为 KIAA1556。 该蛋白含有多个串联的 88 个氨基酸免疫球蛋白(Ig) 样重复序列,与肌球蛋白结合蛋白 C(600958) 和肌联蛋白(188840) 显着相似。 RT-PCR ELISA 检测到心脏、骨骼肌、肾脏和全脑中的表达,而在其他组织(包括胎儿脑)中几乎没有表达。 在各个脑区域内,仅在小脑和尾状核中发现表达。

Young 等人使用肌联蛋白的外周 Z 盘区域作为酵母 2 杂交筛选骨骼肌 cDNA 文库的诱饵,然后筛选心肌 cDNA 文库(2001)克隆OBSCN。 推导的蛋白质含有 6,620 个氨基酸,计算分子量为 720 kD。 N 末端由 49 个 Ig 和 2 个纤连蛋白(参见 135600)III 型(FN3) 结构域组成,大部分串联排列,后面是一个 IQ 基序和一个由 4 个以上 Ig 结构域组成的复杂区域,这些结构域由非模块化序列分隔。 C 末端包含一个 SH3 结构域、一个 Dbl(311030) 同源(DH)/RhoGEF 结构域、一个 血小板-白细胞C 激酶底物(173570) 同源(PH) 结构域、2 个串联 Ig 结构域,最后是一个包含多个共有 ERK 激酶(参见 176872)磷酸化基序拷贝的 417 个氨基酸的非模块化区域。 杨等人(2001) 还鉴定了几种 OBSCN 剪接变体。 人类股外侧肌和心肌的蛋白质印迹分析显示 OBSCN 的表观分子质量为 700 至 900 kD。 表达量相对较低,OBSCN 的丰度估计比 nebulin(161650) 低 10 倍。

拉塞尔等人(2002) 从成人和胎儿骨骼和心肌 cDNA 文库中克隆了 OBSCN。 cDNA 序列编码 68 个 Ig 结构域、2 个纤连蛋白结构域、1 个钙/钙调蛋白结合结构域、1 个具有相关 PH 结构域的 RhoGEF 结构域和 2 个丝氨酸-苏氨酸激酶(SK) 结构域。 拉塞尔等人(2002) 还在 OBSCN 序列中鉴定了 2 个聚腺苷酸化位点。 他们确定,选择性剪接可以产生许多独特的 obscurin 同工型,其中包含功能域的各种组合。 obscurin-RhoGEF/Unc89 样亚型与 Unc89(一种线虫肌节相关蛋白)相当,因为它们包含推定的 RhoGEF 结构域和多个 Ig 重复序列。 obscurin-MLCK 亚型更类似于肌球蛋白轻链激酶(MLCK; 600922),并包含 1 或 2 个 C 端 SK 结构域。 Northern blot 和 PCR 分析检测到几种 OBSCN 转录本主要在心脏和骨骼肌中表达。 在心脏中,SK1 和 SK2 结构域编码转录本主要在没有其他功能结构域的情况下表达。 含有 RhoGEF 结构域的转录物与纤连蛋白和免疫球蛋白结构域一起在心脏中表达,其表达水平比 SK1 和 SK2 编码转录物低得多。

▼ 基因功能

Young 等人在酵母 2 杂交和体外结合测定中使用了肌联蛋白和 OBSCN 的几个重组片段(2001) 确定 OBSCN 的 Ig 结构域 48 和 49 与肌联蛋白的外周 Z 盘 Ig 结构域 Z9 和 Z10 直接相互作用。 使用 obscurin IQ 结构域和侧翼 Ig 结构域 51 和 52 作为酵母 2 杂交筛选中的诱饵,他们发现 OBSCN 还与全长钙调蛋白相互作用(参见 114180)。 与钙调蛋白的结合不依赖于 Ca(2+)。 Young 等人通过新生大鼠心肌细胞中 Obscn 的免疫定位(2001) 确定暗蛋白和肌联蛋白在肌原纤维形成过程中共同组装。 在肌原纤维发生的过程中,所有暗蛋白表位都在 M 带处可检测到。

鲍里索夫等人(2003) 研究了主动脉缩窄引起的小鼠心肌肥厚过程中 obscurin 的表达。 定量 RT-PCR 表明,编码 RhoGEF 结构域和 SK2 结构域的转录物在肥大反应早期和肥大生长过程中均显着上调,尽管激活的时间模式不同。 相比之下,编码 SK1 结构域的转录本在主动脉缩窄后的表达上没有发生显着变化。 obscurin-RhoGEF 蛋白在药物诱导肥大生长的培养大鼠心肌细胞中的免疫定位表明,obscurin-RhoGEF 在形态上与生长的肌原纤维以及肌浆周围肌原纤维发生的起始和进展部位相关。 鲍里索夫等人(2003) 得出结论,obscurin-RhoGEF 合成的上调与附加物的形成有关。