小卡哈尔体特异性 RNA 12; SCARNA12

  • snoRNA,U89

HGNC 批准的基因符号:SCARNA12

细胞遗传学位置:12p13.31 基因组坐标(GRCh38):12:6,967,336-6,967,605(来自 NCBI)

文本

▼ 说明

小核仁 RNA(snoRNA),如 SCARNA12,充当指导 RNA 转录后修饰的指导。 含有 C/D 框的 SnoRNA 与原纤维蛋白(FBL; 134795) 关联,并直接对剪接体小核 RNA(snRNA) 进行 2-prime-O-核糖甲基化,而含有 H/ACA 框的 SnoRNA 与 GAR1(NOLA1; 606468) 关联,并直接对 snRNA 进行假尿苷化。 SCARNA12 包含 C/D 和 H/ACA 框,预计可指导 snRNA 的 2-prime-O-甲基化和假尿苷化(Darzacq 等,2002)。

▼ 克隆与表达

Darzacq 等人通过对 HeLa 细胞中与纤维蛋白免疫沉淀的 RNA 进行测序,(2002) 鉴定了 SCARRNA12,他们将其命名为 U89。 270个核苷酸的RNA包含保守的5-prime box C和3-prime box D基序,可以形成长茎结构和可以折叠成box H/ACA snoRNA共有发夹-铰链-发夹-尾部的中间区域。 在 HeLa 和 COS-7 细胞中过表达后,荧光原位杂交和细胞分级分离显示 U89 与 Cajal 体标记物 coilin(COIL; 600272) 共定位。

▼ 基因功能

Darzacq 等人通过 HeLa 细胞的免疫沉淀分析(2002) 发现人类 U89 与 GAR1 和原纤维蛋白相互作用。

▼ 测绘

达尔扎克等人(2002) 确定 SCARNA12 起源于 PHB2 基因(610704) 的内含子 6,该基因对应到染色体 12p13.31(Hartz, 2013)。