含有三联基序的蛋白质 41; TRIM41
HGNC 批准的基因符号:TRIM41
细胞遗传学定位:5q35.3 基因组坐标(GRCh38):5:181,223,264-181,235,807(来自 NCBI)
文本
▼ 说明
TRIM41 属于三部分基序(TRIM) 蛋白家族,被定义为包含环指、一个或多个 B框 结构域和卷曲螺旋区域(Tanaka 等人,2005)。 请参见 TRIM45(609318)。
▼ 克隆与表达
Kobayashi 和 Hanai(2001) 使用酵母 2 杂交分析来鉴定与 DNA 拓扑异构酶 III β(TOP3B; 603582) 的潜在相互作用伙伴,克隆了部分 TRIM41 cDNA,他们将其描述为一种与 RET 指蛋白(TRIM27; 602165) 相似的新型包含 B 框的蛋白质。 通过使用部分 TRIM41 cDNA 进行数据库检索,Tanaka 等人(2005) 鉴定了 2 个 TRIM41 序列,作者将其命名为 TRIM41-α 和 TRIM41-β,分别编码 660 和 518 个氨基酸的推导蛋白。 2 个异构体具有相同的 N 末端和不同的 C 末端。 两者都包含 PRY 基序、部分 RING 结构域、2 型 B 框和卷曲螺旋基序。 TRIM41-α 在 C 末端含有部分 SPRY 基序。 Northern 印迹分析检测到 2 个主要转录本的普遍表达:一个 4.2-kb 转录本,对应于 α 异构体,以及一个 3.3-kb 转录本,对应于 β 异构体; 后者在睾丸中表达最高。 还检测到了 7.5 kb 的小转录本。 Tanaka 等人使用表达 TRIM41-α 和 TRIM41-β 蛋白和蛋白结构域片段的完整细胞的共聚焦显微镜以及细胞组分的蛋白质印迹分析(2005)将两种亚型定位于细胞质和细胞核中的斑点,对应于细胞核和不溶性细胞质细胞部分。 它们共同的 N 端片段位于细胞核,而它们单独的 C 端片段则位于细胞质。 田中等人(2005) 得出结论,共同的 N 末端片段介导两种亚型的核转移。
▼ 基因结构
田中等人(2005) 确定 TRIM41 基因包含至少 5 个外显子,其中外显子的可变剪接编码同种型的 C 末端区域。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Tanaka 等人(2005) 将 TRIM41 基因定位到染色体 5q35.3