IROQUOIS 同源框蛋白 3; IRX3
- IRXB1
HGNC 批准的基因符号:IRX3
细胞遗传学位置:16q12.2 基因组坐标(GRCh38):16:54,283,303-54,286,786(来自 NCBI)
文本
▼ 说明
IRX3 是易洛魁同源基因基因家族的成员(参见 IRX1;606197),在神经发育的早期阶段发挥作用(Bellefroid 等,1998)。 该家族的成员似乎在脊椎动物胚胎的模式形成过程中发挥多种作用(Lewis 等,1999)。
▼ 克隆与表达
贝尔弗洛伊德等人(1998) 克隆了 Xiro3,它是 IRX3 的非洲爪蟾同源物,并鉴定了人和小鼠 IRX3 序列。 推导的 Xiro3 蛋白与小鼠 Irx3 具有 81% 的同一性,并且与 Lewis 等人鉴定的部分人 IRX3 序列具有相似性(1999)。 推导的小鼠和非洲爪蟾蛋白均含有具有 3 引物酸性区域的同源结构域、2 个潜在的 MAPK 磷酸化位点和一个保守的 C 末端区域。 对小鼠胚胎进行原位杂交,检测到从原肠胚形成结束时即胚胎(E) 第 7.5 天开始的 Irx3 表达。 到 E8.0,表达对增厚的神经外胚层具有特异性,并且在胚胎发生期间通过 E9.5 神经管闭合继续对神经祖细胞具有特异性。
刘易斯等人(1999) 克隆了对应于人类易洛魁同源基因基因(IRX5; 606195) 的全长 cDNA,以及源自 4 个其他 IRX 基因的转录物片段,包括 IRX3(他们称之为 IRX1)。 他们确定人类 IRX 同源结构域与果蝇易洛魁复杂蛋白 caupolican、araucan 和mirror 的同源结构域大约有 90% 相同,并且彼此之间大约有 93% 相同。 每个 IRX 蛋白都包含一个六肽样基序。
▼ 测绘
Gross(2015) 根据 IRX3 序列(GenBank AY335942) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 IRX3 基因对应到染色体 16q12.2。
▼ 基因功能
贝尔弗洛伊德等人(1998) 表明,非洲爪蟾胚胎中 Xiro3 的过度表达会诱导异位神经组织,抑制原代神经元的分化,并增加原神经基因 Xash3(ASCL2; 601886) 表达的空间分布。 此外,Xiro3 在爪蟾动物帽中的过度表达激活了早期神经基因表达。 贝尔弗洛伊德等人(1998) 确定 Xiro3 表达是由 noggin(NOG; 602991) 和 bFGF(FGF2; 134920) 诱导的。
在一项与肥胖相关的 FTO 基因变异(610966) 的研究中,Claussnitzer 等人(2015) 发现 rs1421085 T-C 改变(610966.0003) 破坏了调节基因 ARID5B(608538) 的保守基序,导致有效的前脂肪细胞增强子去抑制,并在早期脂肪细胞分化过程中 IRX3 和 IRX5(606195) 表达加倍。 这导致细胞自主发育从能量耗散的米色(brite)脂肪细胞转变为能量储存的白色脂肪细胞,线粒体生热作用减少 5 倍,脂质储存增加。 抑制小鼠脂肪组织中的 Irx3 可减轻体重并增加能量消耗,而不会改变体力活动或食欲。 克劳斯尼策等人(2015) 得出结论,FTO SNP rs1421085 代表破坏涉及 ARID5B、IRX3 和 IRX5 的脂肪细胞生热途径的因果变异,为 FTO 与肥胖之间的遗传关联提供了机制基础(BMIQ14; 612460)。