修补的域包含蛋白 4; PTCHD4

• 修补蛋白，p53 调节； PTCH53
• 6号染色体开放解读码组138； C6ORF138

HGNC 批准的基因符号：PTCHD4

细胞遗传学定位：6p12.3 基因组坐标（GRCh38）：6:47,856,672-48,111,196（来自 NCBI）

文本

▼ 说明

修补蛋白（例如 PTCHD4）的特点是具有 12 个跨膜结构域和一个甾醇感应结构域的进化保守排列。 PTCHD4 是一个 p53（TP53; 191170） 靶标，可以抑制致癌 hedgehog（参见 SHH, 600725） 途径（Chung et al., 2014）。

▼ 克隆与表达

钟等人（2014） 发现 PTCHD4（他们称之为 PTCH53）是结直肠癌细胞系中 p53 调节的转录物。 推导的 834 个氨基酸的 PTCHD4 蛋白与中央跨膜结构域簇和甾醇感应结构域内的 PTCHD1（300828） 具有 25% 的同一性，与 C 端跨膜结构域簇内的 PTCHD1 具有 23% 的同一性。

▼ 基因结构

钟等人（2014） 确定 PTCHD4 基因包含 5 个外显子。

▼ 测绘

Gross（2016） 根据 PTCHD4 序列（GenBank BC137359） 与基因组序列（GRCh38） 的比对，将 PTCHD4 基因对应到染色体 6p12.3。

▼ 基因功能

Chung 等人使用定量 RT-PCR（2014） 发现与同基因 p53 敲除细胞相比，具有野生型 p53 的 HCT116、RKO 和 SW48 人类癌细胞中 PTCHD4 转录物更加丰富。 数据库分析表明，在携带 p53 突变的癌细胞系中，PTCHD4 的表达水平显着较低。 用 nutlin-3（一种药理学 p53 稳定剂）或伽马射线处理的细胞表现出 PTCHD4 表达升高。 在荧光素酶报告基因检测中，PTCHD4 表达对野生型 p53 有反应，染色质免疫沉淀分析显示 p53 在预测的结合位点直接与 PTCHD4 相互作用。 慢病毒递送 PTCHD4 导致 DAOY 人髓母细胞瘤细胞中刺猬靶基因 GLI1（165220）、PTCH1（601309） 和 PTCH2（603673） 下调。 在 Smo（SMOH; 601500） 敲除的小鼠胚胎成纤维细胞中，外源 SMO 可以通过与 PTCHD4 共转染而受到抑制，这表明 PTCHD4 单独可以通过拮抗 SMO 的作用来抑制 Hedgehog 信号传导。 然而，在用 nutlin-3 处理的细胞中，将 PTCHD4 敲低至中等水平对 GLI1 表达没有显着影响，这表明 PTCHD4 不是稳定 p53 抑制 Hedgehog 活性所必需的。