次要组织相容性 13; HM13
- 组织相容性 13
- 信号肽肽酶; SPP
- 膜内蛋白酶1; 内啡肽1
HGNC 批准的基因符号:HM13
细胞遗传学位置:20q11.21 基因组坐标(GRCh38):20:31,514,441-31,569,542(来自 NCBI)
文本
▼ 说明
信号肽肽酶(SPP)在某些信号肽从前蛋白裂解后催化它们的膜内蛋白水解。 在人类中,SPP 活性需要产生可被免疫系统识别的源自信号序列的人淋巴细胞抗原 E 表位,并处理丙型肝炎病毒核心蛋白。 维霍芬等人(2002) 将人 SPP 鉴定为一种多胞膜蛋白,其序列基序具有早老素型天冬氨酸蛋白酶的特征。
▼ 克隆与表达
维霍芬等人(2002) 从 HeLa 细胞 cDNA 文库中克隆并测序了与 SPP 相对应的人类 cDNA。 该蛋白由 377 个氨基酸组成,具有 7 个假定的跨膜区、4 个潜在的 N-糖基化位点、YD 和 LGLGD 天冬氨酸蛋白酶基序以及内质网(ER) 修复信号 KKXX。 除了 SPP 之外,Weihofen 等人(2002) 鉴定了超过 15 个与人类 SPP 同源的蛋白质,并且根据系统发育树分析可以细分为至少 5 个亚家族。 第一个亚家族包含带有 C 端 ER 修复信号 KKXX 的蛋白质,并包括 SPP。 该亚家族的成员是潜在的直系同源物,并且在整个氨基酸序列中与 SPP 具有同源性(高达 94% 的同一性)。 它们仅存在于高等真核生物中。 其他4个亚家族包含SPP同系物,没有明显的细胞内定位信号。 它们仅在蛋白质的 C 末端部分与 SPP 同源,并且在 N 末端区域显示出显着的变化。 在酿酒酵母和粟酒裂殖酵母的基因组中没有发现 SPP 的潜在直系同源物,这表明 SPP 功能是在进化后期获得的。
Grigorenko 等人通过搜索盘基网柄菌 Impas 的同源物序列数据库,该盘基网柄菌与早老素(104311) 具有同源性,随后对淋巴细胞和海马 cDNA 文库进行 PCR(2002) 克隆了 HM13,他们将其称为 IMP1。 RT-PCR 检测到所有检查的器官和组织中的表达,但心脏和骨骼肌中的表达减少。 转染的人胚胎肾细胞的蛋白质印迹分析表明,IMP1 以约 45 kD 的表观分子质量和约 100 kD 的较高质量迁移。
▼ 基因功能
Lemberg 和 Martoglio(2002) 分析了 SPP 膜内切割的底物要求。 将作为底物的信号肽与未揭示的信号肽进行比较,发现跨膜区域内的螺旋断裂残基是切割所必需的,并且侧翼区域会影响加工。 此外,作者确定信号肽必须通过信号肽酶切割从前体蛋白中释放出来,才能成为 SPP 的底物。
▼ 基因结构
格里戈连科等人(2002)确定IMP1基因含有11个外显子。
▼ 测绘
Grigorenko 等人通过基因组序列分析(2002) 将 HM13 基因定位到 20 号染色体。