原钙粘蛋白-γ,亚科 A,成员 12; PCDHGA12
- PCDH-γ-A12
- 钙粘蛋白,成纤维细胞,3; FIB3
- KIAA0588
- 钙粘蛋白 21,以前; CDH21,以前
HGNC 批准的基因符号:PCDHGA12
细胞遗传学位置:5q31.3 基因组坐标(GRCh38):5:141,430,506-141,512,974(来自 NCBI)
文本
▼ 说明
钙粘蛋白是钙依赖性细胞间粘附分子,原钙粘蛋白构成非经典钙粘蛋白的一个亚家族。 PCDHGA12 是染色体 5q31 上 PCDHG 基因簇(604968) 内 22 个串联排列的基因之一。 22 个 PCDHG 基因作为“可变”外显子发挥作用,分别剪接到下游恒定区以形成不同的 PCDHG 转录本。 可变的 PCDHG 外显子编码原钙粘蛋白的胞外和跨膜结构域,共同区域编码胞内结构域(Wu et al., 2001)。 有关 PCDHG 基因的更多信息,请参阅 604968。
▼ 克隆与表达
为了阐明成纤维细胞间粘附的分子基础,Matsuyoshi 和 Imamura(1997) 使用基于钙粘蛋白保守氨基酸序列的简并引物,通过 RT-PCR 研究了人成纤维细胞中钙粘蛋白的表达。 他们分离出了编码 PCDHGA12 的部分 cDNA,并将其称为 FIB3。 RT-PCR 分析显示,FIB3 在成纤维细胞和角质形成细胞中低水平表达,但在黑素细胞中不表达。
Nagase 等人通过筛选大脑 cDNA 文库中可能编码大蛋白质的基因(1998) 鉴定了编码 PCDHGA12 的 cDNA,他们将其命名为 KIAA0588。 这种由 932 个氨基酸组成的蛋白质与 PCDHGA8(606295) 70% 相同,预计参与细胞信号传导。 RT-PCR 分析检测到普遍存在的表达,但仅在脾脏中较弱。
Wu 和 Maniatis(1999) 通过对脑 cDNA 文库进行 PCR 克隆了全长 PCDHGA12。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Wu 等人(2001) 将 PCDHGA12 基因定位到染色体 5q31,位于 2 个假基因之间,一个邻近 PCDHGB7 基因(606304),另一个邻近 PCDHGC3 基因(603627)。 他们将小鼠 PCDHG 基因定位于 18c 号染色体。