KELCH-LIKE 15; KLHL15
HGNC 批准的基因符号:KLHL15
细胞遗传学位置:Xp22.11 基因组坐标(GRCh38):X:23,983,719-24,027,185(来自 NCBI)
KLHL15属于Kelch样蛋白大家族,包含Kelch和BTB蛋白-蛋白相互作用模块。 二聚 KLHL15 充当包含 CUL3(603136) 的 E3 泛素连接酶的底物接头(Oberg et al., 2012)。
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从尺寸分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2000) 获得了部分 KLHL15 克隆,他们将其命名为 KIAA1677。 RT-PCR ELISA 检测到除成人肺外的所有人类和胎儿组织中都有 KIAA1677 表达。 在成人大脑、肾脏、睾丸和卵巢中检测到最高表达。 在特定的成人大脑区域内,KIAA1677 表达在杏仁核、小脑、胼胝体和丘脑中最高。
通过生物信息学分析,Yoshida(2005) 鉴定了全长人类 KLHL15。 推导的 604 个氨基酸的蛋白质具有 N 端 BTB 结构域和 C 端 Kelch β-螺旋桨结构域,由 3 个大约 50 个残基的 Kelch 重复组成。 KLHL15 与其鸡和斑马鱼直向同源物分别具有 93% 和 85% 的氨基酸同一性。 计算机分析表明 KLHL15 在人体组织中普遍表达。
▼ 基因功能
蛋白磷酸酶-2A(PP2A) 由催化 A 亚基(参见 605983)的核心二聚体和与可变调节 B 亚基结合的结构 C 亚基(参见 176915)组成。 Oberg 等人通过免疫沉淀和质谱分析与 HEK293 细胞中 PP2A 的 B-prime-β 亚基(PPP2R5B;601644)相互作用的蛋白质(2012) 除了 PP2A 的 A 和 C 亚基之外,还鉴定了 KLHL15 和 CUL3。 KLHL15 不与其他 B 素亚基相互作用。 KLHL15 招募了 CUL3-ROC1(RBX1; 603814) E3 连接酶来促进 PP2A 复合物中分离的 B-prime-β 和 B-prime-β 的多泛素化和蛋白酶体降解。 突变分析显示,KLHL15 BTB 结构域内的 asp32 对于 KLHL15 同二聚化是必需的,并且 KLHL15 的 N 端 ILK 基序招募了 CUL3。 asp32 和 ILK 基序都是 KLHL15 依赖性 B-prime-β 降解所必需的。 KLHL15 β 螺旋桨顶部的残基形成底物结合袋并介导 KLHL15 与 B-prime-β 的结合。 B-prime-β 的 N 末端包含泛素化位点并介导与 KLHL15 和 E3 连接酶的相互作用。 B-prime-β 在 tyr52 处的磷酸化对于与 KLHL15 的相互作用至关重要。 除了增加蛋白酶体介导的 B-prime-β 降解之外,KLHL15 的过表达还增加了其他 B-prime 亚基向 PP2A 全酶的掺入。 奥伯格等人(2012) 得出结论,KLHL15 通过指导 B-prime-β 的降解并促进其与其他调节 B 亚基的交换来控制 PP2A 全酶组成和下游磷酸化事件。
▼ 基因结构
Yoshida(2005)确定KLHL15基因含有4个外显子。
▼ 测绘
Nagase 等人通过对人类-啮齿动物杂交组进行 PCR 检测(2000) 将 KLHL15 基因对应到 X 染色体。 Yoshida(2005) 通过基因组序列分析将 KLHL15 基因对应到染色体 Xp22.1。
▼ 分子遗传学
Mignon-Ravix 等人在一名患有 X 连锁智力发育障碍 103(XLID103; 300982) 的男孩中(2014) 在 KLHL15 基因(300980.0001) 中发现了半合子基因内缺失。 他的轻度受影响的母亲被发现携带该缺失,并且淋巴细胞 DNA 中的 XCI 存在偏差(90:10)。 该患者是从 54 名患有 X 连锁智力障碍的男性队列中确定的,这些男性通过阵列 CGH 进行了分析。 对 16 名不同形式的多小脑回患者的 KLHL15 基因编码外显子进行桑格测序,没有发现任何其他突变。 没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。
Hu 等人在来自具有 XLID103 的大型多代家庭(D60) 的 8 名受影响男性中(2016) 在 KLHL15 基因(300980.0002) 中发现了一个半合子截短突变。 该突变是通过 X 染色体外显子组测序发现的,并与该家族中的疾病分离。 没有对该变体进行功能研究。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 智力发育障碍,X 连锁 103
KLHL15,22.5 KB DEL
Mignon-Ravix 等人在一名患有 X 连锁智力发育障碍 103(XLID103; 300982) 的男孩中(2014) 鉴定了涉及 KLHL15 基因前 3 个外显子的半合子 22.5 kb 缺失(chrX.24,020,361_24,042,839,GRCh37)。 没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。
.0002 智力发育障碍,X 连锁 103
KLHL15,1-BP DEL
Hu 等人在来自患有 X 连锁智力发育障碍 103(XLID103; 300982) 的大型多代家庭(D60) 的 8 名受影响男性中。