NICALIN; NCLN

尼卡林,斑马鱼,同系物

HGNC 批准的基因符号:NCLN

细胞遗传学定位:19p13.3 基因组坐标(GRCh38):19:3,185,929-3,209,574(来自 NCBI)

文本

▼ 克隆与表达

通过在数据库中搜索包含尼卡斯特林(605254) 蛋白质家族胞外域的序列,Haffner 等人(2004) 鉴定出尼加林。 推导的 I 型跨膜蛋白的计算分子量为 63.7 kD。 尼卡林含有类似于氨肽酶结构域的区域,但缺乏催化活性所需的氨基酸。 Northern 印迹分析检测到 4.6、4.0 和 2.3 kb 的尼卡林转录物。 最高表达在胰腺和骨骼肌中,在心脏中表达稍低,在所有其他检查组织中表达非常低。 人胚肾细胞和神经母细胞瘤细胞富集膜制剂的 SDS-PAGE 表明内源性尼卡林的表观分子质量为 60 kD。 还在含有 NOMO2 的 500 至 550 kD 复合物中检测到尼卡林(609158)。 尼卡林和 NOMO2 与内质网膜共同分级。

▼ 基因功能

通过共转染细胞的共免疫沉淀,Haffner 等人(2004)证实NOMO2和尼卡林以高分子质量复合物缔合并直接相互作用。 斑马鱼胚胎中这两种蛋白的异位表达会导致独眼症,这是一种由 Nodal(601265) 信号通路介导的中内胚层模式缺陷引起的表型。 此外,在基于细胞的报告基因测定中,尼卡林和 NOMO2 抑制了 Nodal 和激活素(参见 147290)诱导的信号传导。

使用亲和纯化和共免疫沉淀实验,Dettmer 等人(2010) 表明 NOMO 和尼卡林与 TMEM147(613585) 相互作用。 RNA 干扰对这些成分中的每一种的敲除表明它们彼此稳定。 敲低和过表达研究表明尼卡林是该复合物的关键调节剂,并且它在将 TMEM147 纳入复合物之前与 NOMO 结合。 突变分析表明,尼卡林的跨膜结构域是与 TMEM147 相互作用所必需的,但与 NOMO 则不需要。 斑马鱼胚胎的共沉淀研究揭示了尼卡林-NOMO-TMEM147 复合物的保守性。

▼ 测绘

Stumpf(2021) 根据 NCLN 序列(GenBank BC010064) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 NCLN 基因对应到染色体 19p13.3。