DOUBLE 同源基因 A
DUXA 是包含 2 个 PRD(参见167410)类 DNA 结合同源域的双同源基因蛋白家族(参见 DUX4;606009 )的成员( Booth 和 Holland,2007)。
DUXA 在早期胚胎中表达,被认为在胚胎基因组激活和植入前胚胎发育的调节中发挥作用(Tohonen 等人,2015和Madissoon 等人,2016)。
▼ 克隆与表达
Booth 和 Holland(2007)使用 PRD 类同源域查询基因组数据库,确定了 DUXA。推导的 204 个氨基酸蛋白质包含 2 个由 26 个氨基酸间隔区隔开的同源域。EST 分析检测到在软骨肉瘤细胞系中表达的 DUXA。
Tohonen 等人使用单细胞 RNA 测序来自 2 至 3 天大的人类胚胎的卵母细胞、受精卵和卵裂球(2015)确定了在胚胎植入前发育过程中从卵母细胞到 4 细胞阶段以及从 4 细胞到 8 细胞阶段表达的基因。其中包括 PRD 样同源基因基因 DUXA、DUXB( 618698 )、ARGFX( 611164 )、DPRX( 611165 )、LEUTX( 618701 )、CPHX1(CPHXL;618700 ) 和 CPHX2。
麦迪逊等人(2016)报道 DUXA 和 DUXB 的同源域序列分别与 ARGFX 的同源域具有 33% 和 28% 的同一性。
▼ 基因结构
Booth 和 Holland(2007)确定 DUXA 基因包含 6 个外显子,跨度约为 15.8 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Booth 和 Holland(2007)将 DUXA 基因定位到染色体 19q13.43。他们还鉴定了由 8 个整合事件和 2 个串联重复产生的 10 个逆转录假基因。两个重复的对位于染色体 10q11.21 和 14q11.1 上。其他 6 个假基因分散在整个基因组中。
▼ 基因功能
Madissoon 等人在胚胎干细胞(ESC) 中过度表达了 9 个 PRD 样同源框基因,包括DUXA(2016 年)证实,这些基因主要是转录激活因子(例如 ARGFX)或抑制因子(例如 DUXA),并且具有不同的靶标。麦迪逊等人(2016)发现转录起始位点上游的 36 bp 基序富集了受 9 个 PRD 样同源框基因中的大多数调节的基因。