3-PRIME 修复核酸外切酶 2
DNA 复制、修复和重组的多步骤过程需要从 DNA 3 素末端切除核苷酸。含有 3-prime 到 5-prime 核酸外切酶活性的酶,例如 TREX2,可去除错配、修饰、片段化和正常的核苷酸,从而为 DNA 代谢途径中的后续步骤生成适当的 3-prime 末端。
▼ 克隆与表达
通过对 30-kD 牛 Trex1 蛋白的微肽序列分析、简并引物 PCR 和 EST 数据库搜索,Mazur 和 Perrino(1999)获得了编码小鼠和人类 TREX1( 606609 ) 和 TREX2 的 cDNA。序列分析预测,236 个氨基酸的 TREX2 蛋白与 TREX1 有 44% 的同一性。TREX2 包含 3 个保守的外切核酸酶基序,在第三个基序中具有 HxAxxD 序列。
Mazur 和 Perrino(2001)使用 5 素数 RACE 来识别 TREX2 的侧翼区域。RT-PCR 分析检测到 TREX2 的普遍表达。
▼ 基因功能
Mazur 和 Perrino(1999)的功能分析证实,重组 TREX2 蛋白的 3' 到 5' 外切核酸酶活性与天然蛋白相当,并且更喜欢错配的 3' 末端。Mazur 和 Perrino(1999)得出结论,TREX 蛋白是小的、孤立的 3-prime 切除酶,而多功能 p53( 191170 ) 和 WRN(RECQL2; 604611 ) 蛋白也具有 3-prime 到 5-prime 核酸外切酶活动,要大得多。
胡等人(2013)描述了 2 条自发融合反向重复序列以在野生型小鼠胚胎干细胞中产生不稳定染色体重排的途径。伽马辐射诱导了一个 RECQL3( 604610 ) 调节的通路,该通路选择性地融合了相同但不匹配的重复序列。相比之下,紫外线诱导了一种 RAD18( 605256 ) 依赖性途径,该途径有效地融合了错配的重复序列。此外,TREX2 是一种 3 素到 5 素外切酶,可抑制相同的重复融合,但增强错配的重复融合,从而清楚地分离这些途径。TREX2 与 UBC13( 603679 ) 和增强型 PCNA( 176740 ) 相关联) 泛素化以响应紫外线,这与它是无错误复制后修复的新成员一致。RAD18 和 TREX2 还抑制了响应核苷酸耗尽的复制叉停滞。复制叉停滞诱导相同和不匹配重复的融合,暗示错误复制是两种途径的因果机制。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Mazur 和 Perrino(2001)将 TREX2 基因定位到染色体 Xq28。