LUC7, S. Cerevisiae,同源
LUC7L 基因可能代表哺乳动物异染色基因,其编码推定的 RNA 结合蛋白,类似于 U1 snRNP 剪接复合物的酵母 Luc7p 亚基,这通常是 5 素剪接位点选择所需的( Tufarelli et al., 2001 )。
▼ 克隆与表达
Tufarelli 等人使用多种技术(2001)使用来自红白血病细胞系的总 RNA 克隆了 LUC7L。他们确定了几种可变剪接变体。最长的推导蛋白含有 371 个氨基酸,与酿酒酵母 Luc7 蛋白同源。LUC7L 有一个 N 端保守区,后跟一个 C3H 锌指、一个卷曲螺旋结构域、一个 C2H2 RNA 结合锌指、2 个重叠的二分核定位信号和一个 C 端 RS/RE(富含精氨酸丝氨酸和富含精氨酸谷氨酸)基序。Northern印迹分析揭示了在所有检查的组织中约3.5和2.5kb的2个主要转录物。检测到几个额外的 1.4 到 1.6 kb 的转录本。剪接异构体的相对表达在组织内和组织之间变化。
▼ 基因结构
通过基因组序列分析,Tufarelli 等人(2001)确定 LUC7L 基因包含至少 12 个外显子,跨度约为 40.5 kb。LUC7L 基因与 CpG 岛有关。
▼ 基因功能
遗传性人类遗传疾病通常是由破坏基因编码序列或其保守的局部顺式作用序列(包括启动子或 mRNA 处理信号)的突变引起的。不太常见的是,基因表达被远程调控元件的遗传缺失下调,远程调控元件可以位于它们控制的基因上游或下游多达 100 kb 处(Kleinjan 和 van Heyningen,1998)。图法雷利等人(2003)描述了人类遗传疾病的一种新机制。在一个 α-地中海贫血病例中,他们发现一个独特的缺失( 141850.0057 ) 去除了 HBA1 基因( 141800 ) 和 HBQ1 基因( 142240 )) 并将通常位于人类 α-珠蛋白簇下游约 18 kb 的区域与结构正常的成人 α-2-珠蛋白(HBA2; 141850 ) 基因并列。删除该患者的 α(-)-地中海贫血(称为 ZF)并没有去除任何阳性顺式作用序列(Barbour 等人,2000),但结构完整的 α-珠蛋白基因的表达被稳定地沉默,并且在发育过程中, 它的 CpG 岛在大约 2 kb 的区域内被密集甲基化并且对内切核酸酶不敏感。这些表观遗传变化与异常等位基因的复制时间或核区室化的任何改变无关。与α-珠蛋白簇侧翼的基因相关的其他CpG岛不受缺失的影响。图法雷利等人(2003)表明,在受影响的个体中,在转基因模型中,以及在分化胚胎干细胞中,反义 RNA 的转录介导相关 CpG 岛的沉默和甲基化。LUC7L 基因从相反链转录为α-珠蛋白基因。反义 RNA 转录本与一些母系印记基因和 Xist( 314670 ) 相关的 CpG 岛的沉默和甲基化有关,而 Xist(314670) 与 X 染色体失活有关。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Tufarelli 等人(2001)将 LUC7L 基因定位到染色体 16p13.3 上 α-珠蛋白簇(见141800)的着丝粒侧。LUC7L 以与 α-珠蛋白基因相反的方向向端粒转录。通过种间杂交分析和基因组序列分析,他们将小鼠 Luc7l 基因定位到第 17 号染色体,与 11 号染色体上的小鼠 α-珠蛋白簇分离。