DEAD/H (ASP-GLU-ALA-ASP/HIS) 框状多肽 9

RNA 解旋酶在转录、RNA 加工、翻译和 RNA 复制中发挥重要作用。死框蛋白是推定的 RNA 解旋酶,具有特征性 Asp-Glu-Ala-Asp(DEAD) 框作为 8 个高度保守的序列基序之一。见600396。果蝇“无雄性”(MLE) RNA 解旋酶被认为是 X 连锁基因表达的调节剂。Lee 和 Hurwitz(1992)分离并鉴定了人类 RNA 解旋酶 A,它是一种丰富的 130-kD HeLa 细胞核酶,可将双链 RNA 以 3 素数到 5 素数方向展开。通过使用抗 RNA 解旋酶 A 的抗体筛选 HeLa 细胞表达文库,Lee 和 Hurwitz(1993)鉴定了编码该酶的cDNA。预测的 1,279 个氨基酸蛋白与果蝇 MLE 蛋白和 RNA 解旋酶 DEAH 亚家族的其他成员具有序列同源性。MLE 和 RNA 解旋酶 A 的氨基酸序列有 49% 相同,针对 MLE 的抗体识别 RNA 解旋酶 A。HeLa 细胞 RNA 的 Northern 印迹分析显示 RNA 解旋酶 A 的表达为 4.2-kb 转录本。李等人(1998)分离小鼠 RNA 解旋酶 A cDNA。预测的小鼠和人类蛋白质具有 87% 的同一性。

张等人(1995)将牛核 DNA 解旋酶 II(NDHII) 鉴定为人类 RNA 解旋酶 A 的同源物。牛 NDHII 解开 DNA 和 RNA。Zhang 和 Grosse(1997)证明重组人 RNA 解旋酶 A 或 NDHII 也以 ATP 依赖性方式解开双链 RNA 和双链 DNA。他们报告说,该蛋白质在其 N 末端包含 2 个拷贝的双链 RNA 结合结构域、一个 DEIH 解旋酶核心和一个 C 末端 RGG 框核酸结合结构域。通过分析突变蛋白,Zhang 和 Grosse(1997)发现 RNA 结合域和 RGG 框影响和调节 RNA 解旋酶 A 的活性。他们提出了一个模型,其中 RNA 解旋酶 A 参与了 DNA:RNA 杂合体的熔解,例如在转录过程中发生的那些。

白质素(LKP) 是一种 28 kD 的蛋白质,存在于颗粒状 CD8(见186910)阳性和 CD4(186940)阳性细胞毒性 T 淋巴细胞和 U937 单核细胞系中。通过免疫筛选 U937 cDNA 文库,Abdelhaleem 等人(1996)获得了编码 LKP 的 cDNA。免疫荧光显微镜检查证实颗粒酶 A( 140050 ) 阴性颗粒中存在 LKP。推导出的 235 个氨基酸的蛋白质包含多个 N-肉豆蔻酰化位点、一个潜在的 N-连接糖基化位点、一个潜在的 O-连接糖基化位点和 6 个潜在的磷酸化位点。LKP 缺乏典型的 RNA 结合结构域,但与 DDX9 的 C 末端相同。阿卜杜勒哈利姆等人(1996)得出结论,LKP 是颗粒膜的一个组成部分,很可能是 DDX9 的剪接变体。

▼ 基因功能

使用亲和纯化方法,Robb 和 Rana(2007)发现 RHA 与RNA 诱导的沉默复合物中的小干扰 RNA(siRNA)、AGO2( EIF2C2 ; 606229 )、TRBP(TARBP2; 605053 ) 和 DICER( 606241 ) 相关(RISC) 在人类细胞系中。RHA 特异性地与活性 RISC 相互作用,并且在用 siRNA 或短发夹 RNA 编程之前细胞中 RHA 的消耗减少了由于 RISC 形成减少而导致的基因沉默。RHA 消耗也减少了 siRNA 向细胞内 AGO2 的募集,支持 RHA 在 RISC 加载中的作用。

朱等人(2017)发现并机械表征了在肠上皮细胞中特异性表达并限制轮状病毒感染的 Nod 样受体(NLR) Nlrp9b( 609663 )。数据显示,通过 RNA 解旋酶 Dhx9,Nlrp9b 识别短的双链 RNA 延伸,并与衔接蛋白 Asc( 606838 ) 和 半胱天冬酶-1( 147678 ) 形成炎性体复合物,以促进 interleukin-18( 600953 ) 和 gasdermin的成熟D( 617042 ) 诱导的细胞焦亡。体内 Nlrp9b 或其他炎症小体成分的条件性消耗导致小鼠对轮状病毒复制的易感性增强。

阿克塔斯等人(2017 年)报道 DHX9 是一种丰富的核 RNA 解旋酶,可特异性结合反向重复的 Alu 元件,这些元件被转录为基因的一部分。DHX9 的缺失导致产生环状 RNA 的基因数量和环状 RNA 数量增加,含有反向重复 Alu 元件的报告基因的翻译抑制,以及易感基因的转录重新布线(在外显子之间产生大部分无意义的新连接)位点。DHX9 的生化纯化鉴定了 ADAR(146920) 的干扰素诱导异构体(p150 )),但不是组成型表达的 ADAR 异构体(p110),作为不依赖 RNA 的相互作用伙伴。ADAR 和 DHX9 的共缺失增加了双链 RNA 积累缺陷,导致环状 RNA 产量增加,揭示了这两种酶之间的功能联系。阿克塔斯等人(2017)得出结论,他们的工作揭示了 DHX9 的进化保守功能,并提出它作为核 RNA 分解酶,可以中和转座子插入带来的直接威胁,并允许这些元素进化为基因表达的转录后调控工具。

▼ 测绘

李等人(1998)指出 RNA 解旋酶 A 基因对应到人类染色体 1q25。通过分析种间回交,他们将小鼠同源物对应到染色体 1,在显示与人类染色体 1q 同线性同源性的区域中。