γ-丁酰甜菜碱羟化酶
肉碱对于线粒体 β 氧化过程中活化脂肪酸跨线粒体膜的转运至关重要。γ-丁甜菜碱羟化酶(γ-BBH)(EC 1.14.11.1)是左旋肉碱生物合成途径中的最后一种酶,催化γ-丁甜菜碱形成左旋肉碱(Vaz 等人,1998 年总结)。
▼ 克隆与表达
通过用大鼠肝脏 γ-BBH 的部分蛋白质序列搜索 EST 数据库,Vaz 等人(1998)鉴定了同源小鼠 cDNA。他们使用小鼠 cDNA 搜索 EST 数据库,发现了编码 γ-BBH 的人类 cDNA。预测的 387 个氨基酸的人类蛋白质(GenBank AF082868 ) 在酵母中表达时表现出 γ-BBH 活性。Northern 印迹分析表明,γ-BBH 在肾脏中表达为大约 1.7-kb 的 mRNA,在肾脏中表达为高水平,在肝脏中表达为中等水平,在脑中表达为低水平。在其他组织中未检测到表达。作者指出,这种表达模式与先前的研究一致,即发现 γ-BBH 酶活性在肾脏中高,在肝脏中中等,在大脑中低。
Rigault 等人(2006)指出,内源性 BBOX1 作为二聚体蛋白发挥作用,每个亚基的分子量约为 44.7 kD。使用 Northern 印迹分析,他们检测到了一个 1.4 到 1.6 kb 的转录本,该转录本在肾脏中高度表达,在肝脏中适度表达,但在大脑中没有。实时 RT-PCR 证实 BBOX1 在肾脏中的表达高于肝脏,并且在脑中也检测到了表达。EST 数据库分析和 5 素 RACE 揭示了非翻译外显子 1A、1B 和 1C 的组织特异性剪接,每个外显子都有许多转录起始位点。
▼ 基因结构
Rigault 等人(2006)确定 BBOX1 基因跨度为 86.9 kb,包含 9 个外显子,包括交替剪接的外显子 1A、1B 和 1C。外显子 1A、1B 和 1C 是非翻译的,并且每个都有一个功能性的上游启动子区域。没有一个启动子包含 TATA 或 CAAT 框;然而,在外显子 1A 和 1B 周围的区域有许多富含 GC 的元素,并且在外显子 1C 上游有一个 50 个碱基的 GT 重复序列。每个启动子还包含组织特异性和普遍表达的转录因子的推定结合位点。BBOX1 基因的 3 素 UTR 有 2 个多聚腺苷酸化信号。
▼ 测绘
Rigault 等人(2006)指出 BBOX1 基因对应到染色体 11p14.2。