膀胱癌相关转录本 1,非编码
长基因间非编码 RNA(lincRNA) 是超过 200 个核苷酸的非编码 RNA,其基因位于 2 个蛋白质编码基因之间。许多lincRNA参与细胞周期调节、细胞增殖、免疫反应和胚胎干细胞多能性。lincRNAS 与染色质修饰复合物相关,例如多梳抑制复合物-1(PRC1)(参见602978)和 PRC2(参见601573),并充当组蛋白修饰复合物的分子支架。BLACAT1 是一种在膀胱癌组织中上调的 lincRNA( He et al., 2013 )。
▼ 克隆与表达
通过微阵列表达分析,He 等人(2013 年)鉴定了 85 个 lincRNA 和 843 个 mRNA,与邻近的正常组织相比,它们在膀胱癌组织中存在差异表达。在过表达的 lincRNA 中,有 BLACAT1,作者称之为 lincUBC1。他等人(2013)报道 BLACAT1 转录本约为 3 kb,序列分析表明它是非编码的。膀胱癌细胞的核分离显示 BLACAT1 优先定位于细胞核。
▼ 基因功能
He等人使用定量RT-PCR(2013)发现 BLACAT1 在中国广州 102 名患者的 59% 膀胱癌组织中上调,其余显示下调或没有变化。BLACAT1 的过表达与淋巴结转移和术后无转移生存期和总生存期相关。BLACAT1 在膀胱癌细胞系中也被上调。膀胱癌细胞中 BLACAT1 表达的敲低降低了体外细胞增殖、运动性、侵袭性和集落形成。此外,BLACAT1 敲低降低了注射到免疫缺陷小鼠体内的膀胱癌细胞的致瘤性和肺定植。RT-PCR分析显示BLACAT1不影响其邻近基因KLHDC8A( 614503 )、LEMD1(610480 ) 和 CDK18( 169190 )。RNA 免疫沉淀显示 BLACAT1 与 PRC2 复合物的 2 个组分 EZH2( 601573 ) 和 SUZ12( 606245 ) 相互作用。BLACAT1 的敲低导致 PRC2 靶基因的抑制,包括 CCND2( 123833 )、SERPINB2( 173390 )、BMP2( 112261 )、KLF4( 602253 ) 和 HOXA5( 142952 )。EZH2 或 SUZ12 的敲除导致这些基因的类似去抑制。他等人(2013)得出结论,BLACAT1 至少部分地通过调节 PRC2 复合物定位来调节组蛋白甲基化来发挥作用。
▼ 基因结构
他等人(2013)报道 BLACAT1 基因有 1 个外显子。
▼ 测绘
他等人(2013)报道 BLACAT1 基因位于 LEMD1 和 CDK18 基因之间的染色体 1q32.1。