含有 JUMONJI 结构域的蛋白质 2C
Nagase 等人通过对从大小分级的人脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(1998)克隆了 JMJD2C,他们将其命名为 KIAA0780。转录本在其 3 素 UTR 中包含一个 MIR 重复元件,推断的 1,100 个氨基酸蛋白与酿酒酵母锌指蛋白具有显着相似性。RT-PCR ELISA 在所有检查的组织中检测到 JMJD2C 表达。脑中表达最高,骨骼肌和脾脏中表达最低。
已经在源自食管鳞状细胞癌的细胞系中证实了染色体 9p24-p23 处 DNA 拷贝数的频繁扩增(Yang 等人,2000)。杨等人(2000)使用荧光原位杂交和Southern印迹分析来绘制9p24-p23扩增子。然后,他们通过 Northern 印迹分析筛选了该扩增子中存在的靶基因/转录本。通过这种策略,他们克隆了一个基因 JMJD2C,他们将其命名为 GASC1,该基因在多个细胞系中被扩增和过表达。推导出的 1,056 个氨基酸的 GASC1 蛋白包含 2 个 PHD 手指基序和一个 PX 结构域。PHD 指基序是在核蛋白中发现的锌指状序列,参与染色质介导的转录调控,并存在于许多原癌基因中。杨等人(2000)表明 GASC1 的过表达可能在包括食管鳞状细胞癌在内的各种癌症的发生和/或进展中起重要作用。
通过搜索与 JMJD1C( 604503 ) 相似的序列,Katoh 和 Katoh(2004)确定了几个 JMJD2 家族基因,包括 JMJD2C。JMJD2C 编码推断的 1,056 个氨基酸的蛋白质。与 JMJD2A( 609764 ) 和 JMJD2B( 609765 ) 一样,JMJD2C 包含一个 JmjN 结构域、一个 JmjC 结构域、一个 JD2H 结构域、2 个 TUDOR 结构域和一个与第二个 TUDOR 结构域的 C 末端部分重叠的二分核定位信号。JmjN 是在 Jumonji 转录因子家族中发现的一个小结构域(参见601594)。JmjC 是一个推定的酶域。JD2H 是一个包含 2 个 cys-his 簇的区域,与 PHD 域的相似性较弱。
▼ 基因功能
在寻找与三甲基化组蛋白 H3 赖氨酸 9(H3K9) 相互作用的蛋白质和复合物(参见602810)时,Cloos 等人(2006)确定了 JMJD2C(GASC1)。克鲁斯等人(2006)表明,蛋白质 JMJD2 亚家族的 3 个成员通过需要铁和 α-酮戊二酸作为辅助因子的羟基化反应在体外将三甲基化或二甲基化 H3K9 去甲基化。他们还证明了 JMJD2C 或其他 JMJD2 成员的异位表达显着降低了三甲基化和二甲基化 H3K9 水平,增加了单甲基化 H3K9,使 HP1 离域(参见604478),并在体内减少异染色质。与表明 JMJD2C 对肿瘤发展有贡献的研究一致,抑制 JMJD2C 表达会降低细胞增殖。
▼ 测绘
长濑等人(1998)通过辐射杂交分析将 JMJD2C 基因定位到第 9 号染色体。通过基因组序列分析,Katoh 和 Katoh(2004)将 JMJD2C 基因(KDM4C) 定位到染色体 9p24.1。