联合氧化磷酸化缺乏症 18; 侧链霉素 4
SFXN4 是线粒体内膜的跨膜蛋白,是线粒体稳态和造血所需的( Hildick-Smith et al., 2013 )。
▼ 克隆与表达
弗莱明等人(2001)通过在数据库中搜索与小鼠 Sfxn1( 615569 ) 相似的序列来识别小鼠和人类 SFXN4。推导出的 313 个氨基酸的小鼠 Sfxn4 蛋白包含 5 个跨膜结构域和跨膜结构域 1 两侧的保守基序。12 只成年小鼠组织的 Northern 印迹分析检测到肾脏中最高的 Sfxn4 表达,其次是大脑和心脏。在其他组织中几乎没有检测到表达。
通过对从人胎脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,Zheng 等人(2003)克隆了 SFXN4。推导出的 305 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 34.1 kD。它具有一个三羧酸载体结构域和 5 个跨膜片段,与小鼠 Sfxn4 具有 59% 的同一性。EST 数据库分析揭示了一个 SFXN4 剪接变体。RT-PCR 在检查的所有 16 个人体组织中检测到两种 SFXN4 变体的可变表达。
Hildick-Smith 等人使用共聚焦显微镜和蛋白质印迹分析(2013)确定表位标记的人类 SFXN4 定位于转染的 HeLa 细胞中的线粒体。蛋白酶消化实验表明 SFXN4 定位于线粒体内膜。
▼ 基因结构
郑等人(2003)确定 SFXN4 基因包含 15 个外显子,跨度超过 24.7 kb。外显子 4 或 14 在 2 个 SFXN4 剪接变体中被跳过。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Zheng 等人(2003)将 SFXN4 基因对应到染色体 10q25-q26。
Gross(2013)根据 SFXN4 序列(GenBank BC063562 ) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 SFXN4 基因对应到染色体 10q26.11。
▼ 分子遗传学
Hildick-Smith 等人在 2 名合并氧化磷酸化缺陷 18(COXPD18; 615578 )的无关患者中(2013)鉴定了 SFXN4 基因中的纯合或复合杂合突变( 615564.0001 - 615564.0003)。1 名患者通过靶向二代测序和另一名患者的外显子组测序发现了突变。两名患者均存在与线粒体呼吸链活性降低相关的宫内发育迟缓、肌张力减退、视力障碍、言语延迟和乳酸性酸中毒。一个有血液学异常,包括大红细胞性贫血,而另一个有较轻微的红系异常,在正常范围内。野生型 SFXN4 的表达挽救了患者成纤维细胞中的线粒体呼吸链活性缺陷。
▼ 动物模型
希尔迪克-史密斯等人(2013)发现斑马鱼中吗啉代介导的 Sfxn4 敲低显着减少了血红蛋白化细胞的数量,并导致全球线粒体和呼吸链缺陷。通过野生型斑马鱼或人类 SFXN4 的表达拯救了突变动物。
▼ 等位基因变体( 3 精选示例):
.0001 联合氧化磷酸化缺陷 18
SFXN4, 1-BP DEL, 233C
Hildick-Smith 等人在患有联合氧化磷酸化缺陷 18(COXPD18; 615578 )的女孩中(2013)鉴定了 SFXN4 基因中的纯合 1-bp 缺失(c.233delC),导致在编码所有 5 个预测跨膜结构域的区域之前发生移码和过早终止(Pro78LeufsTer26)。该突变是通过靶向二代测序发现的,并与家族中的疾病隔离开来。与对照组相比,患者细胞的 SFXN4 表达降低了 84%,这表明无意义介导的 mRNA 衰变和功能丧失。患者有生长迟缓、轻度神经系统缺陷、视力障碍和大红细胞性贫血。肌肉活检显示线粒体复合物 I 缺乏,患者成纤维细胞显示呼吸链活动的整体缺陷。野生型 SFXN4 的表达挽救了患者成纤维细胞中的线粒体呼吸链活性缺陷。
.0002 联合氧化磷酸化缺乏症 18
SFXN4,1-BP DUP,NT739
Hildick-Smith 等人在患有联合氧化磷酸化缺陷 18(COXPD18; 615578 )的女孩中(2013)鉴定了 SFXN4 基因中的复合杂合突变:1-bp 重复(c.739dup),导致末端 2 个跨膜结构域之前的移码和提前终止(Arg247LysfsTer19),以及 G-to-A 转换(c .471+1G-A;615564.0003) 在内含子 8 中,导致插入内含子 8,添加 38 个氨基酸,并提前终止(Thr158MetfsTer38)。通过外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变与家族中的疾病分离。与对照组相比,患者细胞的 SFXN4 表达降低了 22%,这表明突变是亚型的,这对应于她与具有纯合截断突变的患者( 615564.0001 ) 相比相对温和的表型。野生型 SFXN4 的表达挽救了患者成纤维细胞中的线粒体呼吸链活性缺陷。
.0003 联合氧化磷酸化缺乏症 18
SFXN4,IVS8DS,GA,+1
讨论 SFXN4 基因(c.471+1G-A) 中的剪接位点突变,该突变在复合杂合状态下发现于一名合并氧化磷酸化缺陷 18(COXPD18; 615578 ) 的患者中,作者为Hildick-Smith 等人(2013),见615564.0002。